90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2356 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  89.31 
 
 
393 aa  706    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  86.26 
 
 
393 aa  678    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  89.31 
 
 
393 aa  706    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  89.57 
 
 
393 aa  707    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  89.57 
 
 
393 aa  707    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  89.31 
 
 
393 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  99.24 
 
 
393 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  98.98 
 
 
393 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  99.24 
 
 
393 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  100 
 
 
393 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  99.24 
 
 
393 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  89.06 
 
 
393 aa  704    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  89.31 
 
 
393 aa  706    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  89.31 
 
 
393 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  89.57 
 
 
393 aa  707    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  73.08 
 
 
392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  72.31 
 
 
409 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  71.98 
 
 
392 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  69.97 
 
 
394 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  69.97 
 
 
394 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  68.45 
 
 
393 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  69.97 
 
 
394 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  69.72 
 
 
394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  69.97 
 
 
394 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  69.97 
 
 
394 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  69.97 
 
 
394 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  70 
 
 
392 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  70.06 
 
 
344 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  52.66 
 
 
393 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  52.93 
 
 
393 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  54.26 
 
 
392 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  53.99 
 
 
392 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  53.99 
 
 
392 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  54.26 
 
 
392 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  53.99 
 
 
392 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  52.66 
 
 
393 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  53.72 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  53.3 
 
 
399 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  52.39 
 
 
392 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  48.14 
 
 
360 aa  338  9e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  48.88 
 
 
381 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  31.25 
 
 
404 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  33.42 
 
 
402 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  36.36 
 
 
371 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 
411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  31.76 
 
 
359 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  28.09 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  29.38 
 
 
415 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
444 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  30.53 
 
 
456 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  27.16 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  27.16 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  29.73 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  29.73 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  26.53 
 
 
402 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  31.62 
 
 
431 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  30.81 
 
 
431 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  28.57 
 
 
433 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  25.27 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  23.42 
 
 
392 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
397 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  32.57 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  24.33 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  35.48 
 
 
160 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
403 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  28.67 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 
507 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30 
 
 
507 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
507 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  23.39 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  24.01 
 
 
434 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
474 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  21.16 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  22.88 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.52 
 
 
440 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  23.14 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  23.96 
 
 
386 aa  43.5  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  23.42 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  23.68 
 
 
404 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  34.13 
 
 
441 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 
391 aa  42.7  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  24.58 
 
 
404 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0118645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>