More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2159 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  100 
 
 		 303 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  100 
 
 		 303 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  100 
 
 		 303 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  100 
 
 		 303 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  99.34 
 
 		 303 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  89.3 
 
 		 304 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  40.07 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  28.65 
 
 		 443 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 548 aa  95.9  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  32.65 
 
 		 414 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  28.09 
 
 		 410 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 410 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 359 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 427 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 412 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 513 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  33.1 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.31 
 
 		 530 aa  82.4  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.73 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  33.79 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 493 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  32.17 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  30.36 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  30.36 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 185 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 533 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1399  two component sensor histidine kinase  30.26 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.55 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.39 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 1201 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.94 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  39.39 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  39.39 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.45 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.45 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  39.39 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  37 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.55 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  36.7 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.55 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3661  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.55 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.45 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  36.52 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 515 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  29.3 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.78 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.78 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>