132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2145 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
245 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
245 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
245 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  99.59 
 
 
245 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
245 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.56 
 
 
248 aa  267  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  55.51 
 
 
247 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  56.83 
 
 
254 aa  247  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  58.49 
 
 
246 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.21341e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  56.88 
 
 
247 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  55.51 
 
 
249 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.07 
 
 
235 aa  246  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  56.42 
 
 
247 aa  245  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.09 
 
 
246 aa  244  1e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  55.56 
 
 
246 aa  238  6e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.22 
 
 
249 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.34 
 
 
248 aa  233  2e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.33 
 
 
236 aa  233  2e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.46 
 
 
250 aa  231  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.4 
 
 
251 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  57.28 
 
 
226 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  57.28 
 
 
226 aa  228  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  54.46 
 
 
225 aa  228  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.42 
 
 
250 aa  228  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  54.81 
 
 
234 aa  224  7e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  52.4 
 
 
235 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  55.46 
 
 
249 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  55.83 
 
 
225 aa  219  2e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  50 
 
 
229 aa  219  4e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 
231 aa  218  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.24 
 
 
250 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  48.58 
 
 
235 aa  216  3e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  50.23 
 
 
231 aa  216  3e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.12913e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.46 
 
 
231 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  52.4 
 
 
225 aa  215  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  55.83 
 
 
226 aa  215  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  51.92 
 
 
225 aa  212  4e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  47.75 
 
 
232 aa  210  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  57.22 
 
 
226 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  58.25 
 
 
225 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  50.96 
 
 
225 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 
225 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  58.33 
 
 
228 aa  205  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  50.47 
 
 
231 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  52.58 
 
 
230 aa  201  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.41 
 
 
232 aa  199  2e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.22 
 
 
226 aa  199  4e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  51.92 
 
 
229 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  50.51 
 
 
221 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.37 
 
 
224 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  46.19 
 
 
259 aa  174  1e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  47.8 
 
 
599 aa  173  2e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  42.73 
 
 
245 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  43.17 
 
 
256 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  39.6 
 
 
251 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  39.07 
 
 
321 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  40.93 
 
 
225 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  32.14 
 
 
239 aa  82.4  6e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  31.29 
 
 
226 aa  79.3  5e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.12 
 
 
219 aa  77.8  2e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  32.34 
 
 
242 aa  77.4  2e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.38 
 
 
232 aa  76.3  5e-13  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  33.55 
 
 
330 aa  76.3  5e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  30.19 
 
 
212 aa  75.9  6e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.14 
 
 
241 aa  74.7  1e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.14 
 
 
241 aa  74.3  2e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  25.57 
 
 
325 aa  72.8  4e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  28.22 
 
 
230 aa  71.6  1e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  30.19 
 
 
212 aa  71.6  1e-11  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  31.19 
 
 
210 aa  71.6  1e-11  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  31.55 
 
 
218 aa  70.5  2e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  1.28429e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.03 
 
 
235 aa  70.1  3e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  28.3 
 
 
212 aa  69.3  5e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.4 
 
 
232 aa  68.6  8e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.4 
 
 
232 aa  68.6  8e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.4 
 
 
232 aa  68.6  8e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.31 
 
 
204 aa  68.6  9e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.35 
 
 
261 aa  68.6  9e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.89 
 
 
241 aa  67.4  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.33 
 
 
421 aa  66.6  4e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.06 
 
 
202 aa  65.9  5e-10  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.92 
 
 
216 aa  65.9  6e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  32 
 
 
214 aa  65.5  9e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  31.93 
 
 
226 aa  64.7  1e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  32.48 
 
 
213 aa  63.9  2e-09  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.29 
 
 
246 aa  63.2  4e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.18 
 
 
343 aa  62.8  5e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  29.52 
 
 
339 aa  62.4  6e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.40042e-06  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  32.56 
 
 
352 aa  62  9e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.56 
 
 
242 aa  61.6  1e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  36.23 
 
 
212 aa  61.2  2e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.06 
 
 
202 aa  60.1  3e-08  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.4 
 
 
235 aa  60.5  3e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.01 
 
 
328 aa  60.5  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.91 
 
 
213 aa  59.7  4e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.1 
 
 
326 aa  58.9  7e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.91 
 
 
230 aa  57.4  2e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30 
 
 
218 aa  56.6  3e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.78 
 
 
233 aa  57  3e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.86 
 
 
310 aa  57  3e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>