16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1913 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1913  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
82 aa  168  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.43129e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1373  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
62 aa  125  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  9.52533e-06  hitchhiker  4.64837e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2094  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  125  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  2.79182e-06  decreased coverage  2.48657e-08 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1357  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
62 aa  125  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.06093e-06  normal  0.554848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1388  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  125  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00014342  normal  0.343164 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0191  hypothetical protein  47.46 
 
 
80 aa  53.5  8e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2536  hypothetical protein  49.02 
 
 
84 aa  47.4  6e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.232383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01149  hypothetical protein  41.79 
 
 
88 aa  47  9e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01141  hypothetical protein  41.79 
 
 
88 aa  47  9e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1985  hypothetical protein  41.79 
 
 
88 aa  47  9e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564718  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2460  hypothetical protein  41.79 
 
 
88 aa  47  9e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.420086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1305  hypothetical protein  41.79 
 
 
88 aa  47  9e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1262  hypothetical protein  41.79 
 
 
88 aa  47  9e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0342032  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2482  conserved hypothetical protein  41.79 
 
 
88 aa  47  9e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1754  hypothetical protein  35.21 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0221145  hitchhiker  0.000704146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2840  hypothetical protein  43.14 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00163663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>