37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1672 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1672  putative outer membrane protein  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.147833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1602  putative outer membrane protein  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.985432 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1670  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1611  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1839  putative outer membrane protein  99.01 
 
 
101 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.549082  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1926  hypothetical protein  69.31 
 
 
101 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704459  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2057  protein of unknown function DUF1161  71.29 
 
 
101 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.927614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01545  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2295  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000298038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1614  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2044  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1793  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1659  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01555  hypothetical protein  71.29 
 
 
101 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.41179  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1772  hypothetical protein  70.3 
 
 
101 aa  132  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2348  protein of unknown function DUF1161  55.95 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0734587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2047  hypothetical protein  49 
 
 
99 aa  92  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.58796  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1866  putative lipoprotein  53.09 
 
 
81 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.380587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2287  hypothetical protein  55.84 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581358  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1978  hypothetical protein  53.09 
 
 
81 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0060  hypothetical protein  46.75 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00720  hypothetical protein  45.45 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0041  hypothetical protein  48.28 
 
 
77 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4456  hypothetical protein  43.84 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0151  hypothetical protein  45 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0108  hypothetical protein  41.56 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72225  hitchhiker  0.00358532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3604  hypothetical protein  31.87 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.476197  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0105  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0096  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0090  hypothetical protein  41.56 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0105  hypothetical protein  41.56 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0041  hypothetical protein  39.74 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00480  hypothetical protein  39.74 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0038  hypothetical protein  35.62 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01140  hypothetical protein  38.36 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.147153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0154  hypothetical protein  31.51 
 
 
74 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0099  hypothetical protein  31.51 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>