52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1656 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1627  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1686  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.538481  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1656  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000376444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1822  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1618  hypothetical protein  98.46 
 
 
130 aa  260  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261714  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1628  hypothetical protein  79.23 
 
 
130 aa  221  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000550334  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2109  conserved hypothetical protein  79.23 
 
 
130 aa  221  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01495  hypothetical protein  78.46 
 
 
130 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000630982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1704  hypothetical protein  78.46 
 
 
130 aa  219  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.218779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1626  hypothetical protein  78.46 
 
 
130 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000207773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01506  hypothetical protein  78.46 
 
 
130 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1745  hypothetical protein  78.46 
 
 
130 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2122  hypothetical protein  78.46 
 
 
130 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00124642  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2152  hypothetical protein  77.69 
 
 
130 aa  218  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0166356  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3135  hypothetical protein  65.38 
 
 
130 aa  184  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3313  hypothetical protein  34.13 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0775497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4333  conserved hypothetical protein TIGR00156  33.07 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.958421  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0673  hypothetical protein  33.07 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.107823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02846  hypothetical protein  33.07 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3458  hypothetical protein  33.07 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.185814  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02896  hypothetical protein  33.07 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0676  conserved hypothetical protein  33.07 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3489  hypothetical protein  33.07 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3202  hypothetical protein  33.07 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.729761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3432  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3527  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3357  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3361  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3426  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.847636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2201  YgiW  38.54 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130936  hitchhiker  0.000000000000133429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3428  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2780  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  30.6 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26694  hitchhiker  0.00325347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1397  hypothetical protein  30.6 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1289  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  30.6 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.354318  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3461  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0988  hypothetical protein  31.76 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4529  hypothetical protein  36.25 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4239  hypothetical protein  33.75 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2443  hypothetical protein  31 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0122  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4176  hypothetical protein  30.77 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.374322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0095  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00107366  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0728  hypothetical protein  32.56 
 
 
127 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.474275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2251  hypothetical protein  28.42 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.604545  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000300  hypothetical protein  28.75 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0216597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4785  hypothetical protein  31.43 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000268574  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4639  hypothetical protein  25.81 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4394  hypothetical protein  29.49 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138703  hitchhiker  0.0000181624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1066  hypothetical protein  28.89 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0288  hypothetical protein  27.72 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3424  hypothetical protein  29.58 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1210  hypothetical protein  21.65 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00504058  normal  0.396319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>