38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1554 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  100 
 
 
222 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  100 
 
 
222 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  100 
 
 
222 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  98.65 
 
 
222 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  84.68 
 
 
222 aa  400  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  84.68 
 
 
222 aa  400  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  84.68 
 
 
222 aa  400  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.675861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  84.68 
 
 
222 aa  400  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  84.68 
 
 
222 aa  400  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  84.68 
 
 
222 aa  400  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  84.68 
 
 
222 aa  400  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  84.23 
 
 
222 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  77.48 
 
 
223 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  46.31 
 
 
217 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4813  hypothetical protein  49.25 
 
 
223 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.910755  hitchhiker  0.000170141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  44.44 
 
 
225 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  40.57 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  43.19 
 
 
222 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  40.76 
 
 
224 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  40.28 
 
 
224 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  41.67 
 
 
225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  40.62 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  40.62 
 
 
225 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  42.71 
 
 
220 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  36.54 
 
 
223 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  36.28 
 
 
226 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  33.33 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  31.13 
 
 
223 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  29.9 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  27.12 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  28.21 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  26.99 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  26.71 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  28.43 
 
 
226 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  25.17 
 
 
211 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  23.78 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  30.23 
 
 
219 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>