45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1486 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  99.12 
 
 
228 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  98.25 
 
 
228 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  98.25 
 
 
228 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  97.81 
 
 
228 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  66.23 
 
 
228 aa  311  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  64.89 
 
 
239 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  63.84 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  57.35 
 
 
227 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  47.9 
 
 
235 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  47.93 
 
 
228 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  39.09 
 
 
222 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  40.67 
 
 
240 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  38.39 
 
 
242 aa  148  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  46.43 
 
 
218 aa  131  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  40.26 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  38.99 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  37.74 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  41.73 
 
 
241 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  43.51 
 
 
235 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  35.03 
 
 
231 aa  104  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  38.69 
 
 
236 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  34.39 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  37.5 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  88.2  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  35.56 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  32.64 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  29.81 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  29.19 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  29.81 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  24.68 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  31.85 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  27.88 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  28.46 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  25.19 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  23.29 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  26.09 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  26.49 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  20.78 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  25.6 
 
 
236 aa  41.6  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>