161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1329 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  97.06 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  97.06 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  64.81 
 
 		 515 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  68.15 
 
 		 522 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2255  SpoVR family protein  65.71 
 
 		 576 aa  706    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  100 
 
 		 510 aa  1073    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3487  SpoVR family protein  69.82 
 
 		 512 aa  761    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.241137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  72.46 
 
 		 508 aa  805    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  66.94 
 
 		 520 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  86.84 
 
 		 511 aa  924    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  75.2 
 
 		 505 aa  822    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  97.25 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  66.8 
 
 		 507 aa  713    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  66.8 
 
 		 507 aa  714    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  67.75 
 
 		 520 aa  738    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  65.26 
 
 		 517 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 509 aa  734    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  65.23 
 
 		 560 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  86.31 
 
 		 513 aa  937    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  67.55 
 
 		 523 aa  720    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  65.38 
 
 		 559 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  65.18 
 
 		 559 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  85.71 
 
 		 519 aa  932    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02753  SpoVR family protein  73.47 
 
 		 515 aa  783    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  65.64 
 
 		 560 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  100 
 
 		 510 aa  1073    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  67.07 
 
 		 511 aa  720    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  67.61 
 
 		 515 aa  732    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  65.93 
 
 		 520 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2007  SpoVR family protein  65.51 
 
 		 552 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1636  SpoVR family protein  73.23 
 
 		 504 aa  793    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000747677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  66.33 
 
 		 516 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3906  SpoVR family protein  65.26 
 
 		 512 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  65.38 
 
 		 507 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  72.46 
 
 		 521 aa  790    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  83.33 
 
 		 511 aa  914    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  74.65 
 
 		 508 aa  814    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  73.79 
 
 		 508 aa  808    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  74.19 
 
 		 508 aa  811    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1744  SpoVR family protein  71.69 
 
 		 513 aa  767    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  65.18 
 
 		 559 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  68.35 
 
 		 517 aa  722    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  65.38 
 
 		 559 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  73.44 
 
 		 508 aa  808    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  67.71 
 
 		 532 aa  708    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  74.55 
 
 		 507 aa  801    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  62.8 
 
 		 507 aa  688    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  68.42 
 
 		 519 aa  735    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  67.55 
 
 		 522 aa  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  65.23 
 
 		 560 aa  698    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  65.34 
 
 		 538 aa  703    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  65.23 
 
 		 560 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  74.95 
 
 		 519 aa  820    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  74.44 
 
 		 508 aa  810    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  65.23 
 
 		 560 aa  698    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  65.23 
 
 		 560 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  65.23 
 
 		 560 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1831  SpoVR family protein  72.37 
 
 		 510 aa  796    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  99.41 
 
 		 510 aa  1066    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  96.47 
 
 		 510 aa  1043    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  73.2 
 
 		 505 aa  808    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  67.99 
 
 		 521 aa  750    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  75.25 
 
 		 516 aa  827    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  65.77 
 
 		 578 aa  705    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  68.36 
 
 		 522 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  68.97 
 
 		 520 aa  745    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  68.15 
 
 		 517 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  74.65 
 
 		 508 aa  813    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  99.61 
 
 		 510 aa  1068    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  84.54 
 
 		 511 aa  913    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  97.06 
 
 		 510 aa  1045    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  76.81 
 
 		 519 aa  825    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  97.06 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  97.06 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2448  SpoVR family protein  72.89 
 
 		 506 aa  798    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0619548  normal  0.114389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  87.75 
 
 		 511 aa  941    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  74.1 
 
 		 504 aa  797    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  99.8 
 
 		 510 aa  1070    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  74.85 
 
 		 508 aa  814    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  62.57 
 
 		 542 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  65.38 
 
 		 557 aa  705    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296087 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  84.34 
 
 		 511 aa  911    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  64.13 
 
 		 502 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  70.43 
 
 		 517 aa  749    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  68.36 
 
 		 522 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  64.13 
 
 		 502 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  84.54 
 
 		 511 aa  913    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  97.06 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  97.06 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  67.95 
 
 		 522 aa  709    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  97.06 
 
 		 510 aa  1048    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  72.78 
 
 		 508 aa  793    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  65.38 
 
 		 559 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0535  SpoVR family protein  56.02 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.468104  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0257  SpoVR family protein  55.35 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1029  SpoVR family protein  53.66 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0974  SpoVR family protein  52.26 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1223  SpoVR family protein  55.44 
 
 		 522 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297925  normal  0.137117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1691  SpoVR family protein  56.06 
 
 		 519 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6312  SpoVR family protein  56.2 
 
 		 512 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>