99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1194 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  99.3 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  76.76 
 
 		 142 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  76.06 
 
 		 142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  76.06 
 
 		 142 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  76.06 
 
 		 142 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  76.06 
 
 		 142 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  76.06 
 
 		 142 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  76.06 
 
 		 142 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  76.06 
 
 		 142 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  70.21 
 
 		 141 aa  219  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  46.76 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  44.29 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  43.36 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  41.96 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  41.96 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  41.96 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  41.96 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  42.14 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  41.43 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  41.43 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  41.43 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  41.43 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  40.71 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  41.43 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  41.43 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  41.43 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  41.43 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  40.71 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  40.71 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  40.71 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  40.71 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  40.71 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  38.57 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  38.57 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  38.57 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  34.29 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  35.14 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  34.97 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  36.05 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  33.79 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  29.29 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  34.06 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  30.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  30.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  30.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  30.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  30.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  30.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  30.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  30.71 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  30.71 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  32.17 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  29.86 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  31.47 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  30.28 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  30.28 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  31.72 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  26.06 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  24.65 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  24.65 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  23.91 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  25.69 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  25.86 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2742  hypothetical protein  29.05 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  25.52 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  24.65 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  24.14 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  23.45 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  29.49 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  23.45 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  23.45 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  29.49 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  28.47 
 
 		 153 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  27.73 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  25.87 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.76 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  27.27 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0071  UspA domain protein  35.71 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041598  normal  0.631556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  27.7 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  25.17 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  25.19 
 
 		 139 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>