31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1188 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  99.53 
 
 
212 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  99.53 
 
 
212 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  99.53 
 
 
212 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  99.05 
 
 
212 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  91.83 
 
 
212 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  88.15 
 
 
212 aa  387  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  88.15 
 
 
212 aa  387  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  88.15 
 
 
212 aa  387  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  73.93 
 
 
211 aa  329  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  73.46 
 
 
212 aa  321  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  70.62 
 
 
211 aa  308  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  71.35 
 
 
185 aa  266  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  54.25 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  51.89 
 
 
213 aa  228  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  51.42 
 
 
211 aa  227  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  52.36 
 
 
212 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  54.72 
 
 
212 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  51.42 
 
 
212 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  49.76 
 
 
217 aa  217  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  53.77 
 
 
212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  47.39 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  49.53 
 
 
213 aa  199  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  29.32 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  31.58 
 
 
140 aa  49.3  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.83 
 
 
149 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  29.35 
 
 
143 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  29.23 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.33 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  36.84 
 
 
145 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  24.65 
 
 
370 aa  42  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>