55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1023 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  99.47 
 
 
187 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  84.49 
 
 
187 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  84.49 
 
 
187 aa  327  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  84.49 
 
 
187 aa  327  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  84.49 
 
 
187 aa  327  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  84.49 
 
 
187 aa  327  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  84.49 
 
 
187 aa  327  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  84.49 
 
 
187 aa  327  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  83.52 
 
 
182 aa  315  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  83.52 
 
 
182 aa  315  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  77.66 
 
 
188 aa  310  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  60.22 
 
 
185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  57.81 
 
 
192 aa  230  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  57.29 
 
 
192 aa  227  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  57.29 
 
 
192 aa  227  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  56.83 
 
 
182 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  56.83 
 
 
182 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  55.08 
 
 
188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  54.26 
 
 
188 aa  207  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  45.16 
 
 
186 aa  157  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  43.55 
 
 
185 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  31.05 
 
 
211 aa  86.3  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  33.69 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  30.89 
 
 
199 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  33.5 
 
 
197 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  33.52 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  31.77 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  29.41 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  25.68 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  26.46 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  29.79 
 
 
201 aa  61.6  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  27.51 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  30.22 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  25.95 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  22.92 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  30.94 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  23.46 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  24.87 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  24.47 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  23.91 
 
 
212 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.9 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  27.16 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  23.04 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  26.92 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  24.32 
 
 
201 aa  44.7  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  22.34 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25.15 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  28.36 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  38.33 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  26.28 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  36.67 
 
 
222 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>