More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0727 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  95.13 
 
 
554 aa  1110    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  94.95 
 
 
554 aa  1108    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  59.89 
 
 
563 aa  674    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  91.7 
 
 
554 aa  1080    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  68.77 
 
 
554 aa  824    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  69.86 
 
 
554 aa  832    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  59.18 
 
 
564 aa  660    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  837    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  838    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  70.2 
 
 
557 aa  836    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  75.45 
 
 
554 aa  903    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  65.41 
 
 
562 aa  785    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  74.73 
 
 
554 aa  899    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  99.46 
 
 
554 aa  1152    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  70.44 
 
 
556 aa  849    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  69.86 
 
 
552 aa  827    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  92.06 
 
 
554 aa  1063    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  70.22 
 
 
554 aa  835    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  69.68 
 
 
553 aa  835    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  838    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  67.21 
 
 
558 aa  795    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  94.4 
 
 
554 aa  1104    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  94.77 
 
 
554 aa  1107    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  89.35 
 
 
554 aa  1052    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  99.64 
 
 
554 aa  1157    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  89.53 
 
 
554 aa  1054    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  70.04 
 
 
554 aa  835    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  837    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  91.88 
 
 
554 aa  1078    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  68.47 
 
 
555 aa  816    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  75.09 
 
 
554 aa  904    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  95.13 
 
 
554 aa  1110    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  99.82 
 
 
554 aa  1158    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  91.7 
 
 
554 aa  1079    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  89.53 
 
 
554 aa  1054    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  71.53 
 
 
556 aa  862    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  94.95 
 
 
554 aa  1108    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  95.13 
 
 
554 aa  1110    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  70.22 
 
 
554 aa  833    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  70.22 
 
 
554 aa  836    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  69.31 
 
 
554 aa  816    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  59.89 
 
 
563 aa  653    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  91.88 
 
 
554 aa  1080    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  836    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  94.77 
 
 
554 aa  1106    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  70.04 
 
 
554 aa  826    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  94.04 
 
 
554 aa  1100    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  70.76 
 
 
556 aa  845    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  74.91 
 
 
555 aa  906    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  100 
 
 
554 aa  1160    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  99.64 
 
 
554 aa  1157    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  59.71 
 
 
563 aa  672    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  95.13 
 
 
554 aa  1110    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  51.28 
 
 
596 aa  598  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  49.83 
 
 
592 aa  569  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  47.59 
 
 
571 aa  548  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  47.27 
 
 
573 aa  507  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  44.62 
 
 
638 aa  473  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  44.57 
 
 
537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  42.47 
 
 
543 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  40.43 
 
 
503 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.39 
 
 
528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  37.93 
 
 
537 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  36.72 
 
 
498 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  39.72 
 
 
530 aa  297  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  35.94 
 
 
498 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.43 
 
 
512 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  31.19 
 
 
492 aa  229  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.96 
 
 
510 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.96 
 
 
484 aa  209  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  30.12 
 
 
482 aa  203  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.74 
 
 
592 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.42 
 
 
660 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.67 
 
 
660 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.19 
 
 
606 aa  193  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.5 
 
 
664 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.7 
 
 
658 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.25 
 
 
583 aa  189  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.43 
 
 
633 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.23 
 
 
666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.23 
 
 
678 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.67 
 
 
633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.33 
 
 
635 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.18 
 
 
633 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.18 
 
 
633 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  32.18 
 
 
633 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  32.18 
 
 
633 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.18 
 
 
633 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.18 
 
 
633 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.17 
 
 
627 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.18 
 
 
633 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.18 
 
 
633 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.3 
 
 
514 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3421  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.69 
 
 
662 aa  183  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>