More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0619 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



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Fosmid unclonability p-value
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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  99.48 
 
 		 193 aa  396  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  99.48 
 
 		 193 aa  396  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 196 aa  286  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  52.66 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  41.8 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 192 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  35.29 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  34.13 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  47.37 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
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NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  32.04 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  44.83 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  51.02 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  30.11 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  33.93 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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