294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0592 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  99.31 
 
 		 870 aa  1766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  71.06 
 
 		 869 aa  1303    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  47.83 
 
 		 878 aa  800    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  47.3 
 
 		 866 aa  773    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  48.06 
 
 		 856 aa  798    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  47.4 
 
 		 878 aa  804    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  71.06 
 
 		 869 aa  1303    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  47.41 
 
 		 866 aa  778    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  41.25 
 
 		 842 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  70.6 
 
 		 867 aa  1288    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  49.11 
 
 		 888 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  47.29 
 
 		 878 aa  801    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  71.06 
 
 		 869 aa  1301    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  70.71 
 
 		 869 aa  1293    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  47.59 
 
 		 866 aa  777    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  71.06 
 
 		 869 aa  1301    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  49.11 
 
 		 888 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  49.11 
 
 		 888 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  47.59 
 
 		 866 aa  777    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  41.25 
 
 		 842 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  99.31 
 
 		 870 aa  1768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  47.3 
 
 		 866 aa  773    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.17 
 
 		 837 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  49.23 
 
 		 888 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  47.17 
 
 		 866 aa  776    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  41.25 
 
 		 842 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  99.31 
 
 		 870 aa  1769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  51.93 
 
 		 876 aa  868    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.98 
 
 		 840 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  47.4 
 
 		 878 aa  804    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  47.83 
 
 		 863 aa  802    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  49.11 
 
 		 873 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  47.41 
 
 		 866 aa  771    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  100 
 
 		 870 aa  1778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  71.18 
 
 		 869 aa  1304    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  70.96 
 
 		 833 aa  1236    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  49.48 
 
 		 877 aa  816    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  42.73 
 
 		 871 aa  683    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  99.31 
 
 		 870 aa  1766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  41.39 
 
 		 851 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  43.57 
 
 		 740 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  38.83 
 
 		 840 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  38.03 
 
 		 839 aa  595  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  37.92 
 
 		 844 aa  592  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  40.19 
 
 		 848 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  39.95 
 
 		 848 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  39.95 
 
 		 848 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  39.72 
 
 		 848 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  39.84 
 
 		 848 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  39.48 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  39.48 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  39.48 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  39.36 
 
 		 809 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  39.36 
 
 		 809 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  37.97 
 
 		 838 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.08 
 
 		 838 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.97 
 
 		 838 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  38.08 
 
 		 863 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  38.08 
 
 		 838 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  38.2 
 
 		 838 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  37.97 
 
 		 838 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.86 
 
 		 871 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.68 
 
 		 851 aa  537  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.2 
 
 		 859 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  37.02 
 
 		 850 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  36.79 
 
 		 833 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  36.83 
 
 		 833 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  36.79 
 
 		 833 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  36.86 
 
 		 839 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.76 
 
 		 901 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  36.97 
 
 		 901 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.9 
 
 		 861 aa  479  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.2 
 
 		 872 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.13 
 
 		 828 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.95 
 
 		 880 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.24 
 
 		 886 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.33 
 
 		 866 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.41 
 
 		 844 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.88 
 
 		 884 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34 
 
 		 867 aa  459  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  36.66 
 
 		 836 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  35.2 
 
 		 870 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.89 
 
 		 870 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  35.14 
 
 		 839 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.14 
 
 		 851 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.79 
 
 		 850 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.93 
 
 		 1040 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  36.94 
 
 		 836 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  36.59 
 
 		 836 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0084  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.49 
 
 		 818 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  36.94 
 
 		 836 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.44 
 
 		 835 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.94 
 
 		 963 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.89 
 
 		 851 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.14 
 
 		 875 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.14 
 
 		 875 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.52 
 
 		 853 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.61 
 
 		 837 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  34.19 
 
 		 888 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.95 
 
 		 883 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>