More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0331 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.26 
 
 
823 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  97.97 
 
 
836 aa  1679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  98.33 
 
 
836 aa  1687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.33 
 
 
837 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  98.8 
 
 
836 aa  1697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  46.38 
 
 
823 aa  718    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  100 
 
 
836 aa  1718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  46.38 
 
 
823 aa  718    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.87 
 
 
840 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  41.5 
 
 
851 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  39.54 
 
 
809 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  38.98 
 
 
809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  38.98 
 
 
809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  38.86 
 
 
809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  38.98 
 
 
809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  36.26 
 
 
848 aa  515  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  35.86 
 
 
848 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  36.46 
 
 
848 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  35.62 
 
 
848 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  35.98 
 
 
848 aa  509  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.41 
 
 
878 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  36.64 
 
 
863 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  36.41 
 
 
878 aa  502  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  36.41 
 
 
878 aa  502  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  35.95 
 
 
842 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  34.63 
 
 
814 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  36.18 
 
 
878 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  36.18 
 
 
856 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.96 
 
 
866 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.4 
 
 
876 aa  495  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  35.83 
 
 
842 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  35.83 
 
 
842 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.834184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  34.84 
 
 
866 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  34.84 
 
 
866 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  34.96 
 
 
866 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  34.84 
 
 
866 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  35.08 
 
 
866 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  34.84 
 
 
866 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  36.68 
 
 
888 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  36.68 
 
 
873 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  36.56 
 
 
888 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.1 
 
 
859 aa  475  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  36.68 
 
 
888 aa  476  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.58 
 
 
833 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  36.44 
 
 
888 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.89 
 
 
877 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  35.54 
 
 
838 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.66 
 
 
838 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  35.77 
 
 
838 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  35.54 
 
 
838 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  36.55 
 
 
870 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.42 
 
 
838 aa  459  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  34.02 
 
 
871 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  35.3 
 
 
838 aa  459  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  35.66 
 
 
863 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  36.78 
 
 
870 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  36.66 
 
 
870 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  36.78 
 
 
870 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  36.66 
 
 
870 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.11 
 
 
867 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  34.98 
 
 
869 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  35.1 
 
 
869 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  34.98 
 
 
869 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  34.98 
 
 
869 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.85 
 
 
851 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.98 
 
 
869 aa  446  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  34.2 
 
 
869 aa  439  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  33.41 
 
 
839 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  32.97 
 
 
840 aa  419  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  35.33 
 
 
740 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  32.32 
 
 
844 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.39 
 
 
880 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.33 
 
 
861 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  32.38 
 
 
839 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.99 
 
 
886 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.36 
 
 
871 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.97 
 
 
851 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  32.42 
 
 
901 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  31.42 
 
 
850 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.46 
 
 
828 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  31.54 
 
 
833 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  31.3 
 
 
833 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.81 
 
 
866 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  30.72 
 
 
833 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.18 
 
 
901 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.94 
 
 
844 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.06 
 
 
930 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.66 
 
 
835 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0084  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.84 
 
 
818 aa  361  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.62 
 
 
884 aa  359  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  32.44 
 
 
839 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.77 
 
 
867 aa  356  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  31.25 
 
 
939 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.09 
 
 
872 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.36 
 
 
866 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.33 
 
 
851 aa  352  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.66 
 
 
1040 aa  350  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.99 
 
 
875 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.99 
 
 
875 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  32.12 
 
 
837 aa  347  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>