74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0168 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  99.37 
 
 
316 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  100 
 
 
316 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  99.05 
 
 
316 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  99.68 
 
 
316 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  99.05 
 
 
316 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  83.86 
 
 
316 aa  572  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  68.25 
 
 
316 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.12 
 
 
314 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.09 
 
 
315 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.55 
 
 
315 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  57.1 
 
 
344 aa  372  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  54.66 
 
 
580 aa  363  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  53.02 
 
 
341 aa  353  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.9 
 
 
505 aa  348  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.31 
 
 
315 aa  345  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  53.02 
 
 
340 aa  345  7e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.63 
 
 
648 aa  328  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  51.92 
 
 
362 aa  328  9e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.55 
 
 
378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.23 
 
 
378 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  48.23 
 
 
377 aa  309  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.44 
 
 
369 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.03 
 
 
426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.07 
 
 
392 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.5 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.5 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  43.81 
 
 
333 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.62 
 
 
350 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.91 
 
 
340 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.88 
 
 
376 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.89 
 
 
347 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.174999 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  33.86 
 
 
329 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.99 
 
 
507 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.71 
 
 
355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  32.92 
 
 
349 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.94 
 
 
2073 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.7 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  32.49 
 
 
355 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.09 
 
 
466 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.15 
 
 
517 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.95 
 
 
607 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.35 
 
 
628 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  31.66 
 
 
627 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 
634 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
634 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
634 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  30.72 
 
 
502 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  27.25 
 
 
710 aa  93.2  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  26.11 
 
 
1278 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.52 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.52 
 
 
713 aa  63.9  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.68 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 
537 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.61 
 
 
393 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  27.08 
 
 
306 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.45 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.8 
 
 
540 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 
514 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.08 
 
 
545 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  22.15 
 
 
535 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.45 
 
 
495 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  24.28 
 
 
522 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  21.66 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  26.41 
 
 
338 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 
516 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  23.57 
 
 
537 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.7 
 
 
524 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 
505 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  22.89 
 
 
384 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.89 
 
 
472 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>