More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3667 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  100 
 
 		 376 aa  764    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  77.39 
 
 		 376 aa  596  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  76.33 
 
 		 376 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  70.48 
 
 		 376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  66.76 
 
 		 376 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.4 
 
 		 375 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  42.93 
 
 		 375 aa  332  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.74 
 
 		 379 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.94 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.94 
 
 		 378 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.19 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.11 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.16 
 
 		 378 aa  289  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.13 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.78 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  39.42 
 
 		 374 aa  279  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.14 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.78 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4425  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.18 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.86 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.27 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  37 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.82 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0213  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.84 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4645  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.675327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.98 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0164  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 		 379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.84 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.51 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.07 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.34 
 
 		 379 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.71 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.24 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.67 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.52 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.53 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  38 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.3 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.59 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.2 
 
 		 376 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.15 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.22 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.1 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.94 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.68 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.98 
 
 		 383 aa  255  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.75 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.46 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.05 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.05 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.1 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.49 
 
 		 376 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.49 
 
 		 376 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.11 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.21 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.54 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.73 
 
 		 381 aa  250  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.89 
 
 		 376 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.89 
 
 		 376 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.89 
 
 		 376 aa  249  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.93 
 
 		 376 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.1 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.25 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.36 
 
 		 376 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.75 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.51 
 
 		 376 aa  246  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.83 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.48 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.27 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.93 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.25 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.25 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.25 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.38 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.25 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.97 
 
 		 382 aa  235  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  36 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.54 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.84 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  35.22 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.92 
 
 		 398 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  35.34 
 
 		 369 aa  225  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.31 
 
 		 376 aa  225  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.49 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01851  flagellar biosynthesis protein B  37.33 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.33 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.87 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0569687 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.87 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1752  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.33 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  37.33 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.81 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.47 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.2 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.2 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.16 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3077  flagellar biosynthesis protein  35.49 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>