262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3663 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 122 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  70.34 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  65.25 
 
 		 118 aa  150  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  68.64 
 
 		 124 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  77.01 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04968  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  49.5 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001181  flagellar motor switch protein FliN  47.62 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4421  flagellar motor switch protein FliN  46.08 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.465417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0627  flagellar motor switch protein FliN  40.95 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0707  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00348203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0238  flagellar switch protein  39.05 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.137291  normal  0.0537834 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0246  lateral flagellar export/assembly protein LfiN  46.84 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3386  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.84 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  40.74 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  36.04 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  36.04 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  36.04 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  36.04 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  36.04 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  42.47 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  42.47 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  37.35 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  41.1 
 
 		 203 aa  66.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  42.47 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  38.67 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  38.04 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  35.23 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  38.1 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  35.14 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4649  flagellar motor switch protein FliN  35.56 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.519755  normal  0.588244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  37.08 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  38.1 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  42.47 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  38.68 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  38.2 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  43.94 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  38.1 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  43.68 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  41.1 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  37.08 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  43.06 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1459  flagellar motor switch protein FliN  41.1 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.717183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  34.52 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  46.91 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  36.84 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  34.52 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  30.19 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3592  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.8 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  31.25 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  39.73 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  36.9 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  39.19 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  35.8 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  34.21 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  34.67 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  37.33 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  30.84 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  35.8 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  41.1 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  30.84 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  46.34 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  39.73 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  35.8 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  35.8 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  41.1 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  42.47 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  36.05 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  39.73 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  33.64 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  35.48 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  34.04 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0168  flagellar motor switch protein FliN  37.93 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  40.91 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  35.8 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  34.58 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  34.58 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  34.07 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  41.57 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  36.99 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  37.63 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  39.73 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  35.8 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  35.53 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>