17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3654 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3654  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3471  hypothetical protein  61.49 
 
 		 151 aa  180  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.370785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3974  hypothetical protein  60.81 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  52.86 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  49.29 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0716  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0229  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0636  putative flagellar protein FlgN  35.29 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  28.89 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04906  hypothetical protein  29.46 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  28.57 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000743  LfgN  34.23 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4411  hypothetical protein  30.99 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0602809 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0235  hypothetical protein  24.81 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3599  ATPases involved in pili biogenesis, PilT  28.57 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17150  hypothetical protein  25.62 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0888  FlgN family protein  28.57 
 
 		 159 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0650773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>