216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3641 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  100 
 
 		 305 aa  617  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  68.2 
 
 		 305 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  67.54 
 
 		 305 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  63.61 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  62.95 
 
 		 305 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  35.31 
 
 		 305 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  33.11 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  33.11 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  30.84 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  30.19 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  30.19 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  28.57 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  25.9 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  34.57 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  26.28 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 		 562 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0217  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  27.24 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  31.29 
 
 		 410 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  25.57 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  31.79 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  31.18 
 
 		 404 aa  96.3  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  28.37 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  30.72 
 
 		 521 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  32.61 
 
 		 412 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  31.25 
 
 		 400 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  29 
 
 		 408 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  36.02 
 
 		 523 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  33.52 
 
 		 420 aa  92.8  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  30.36 
 
 		 401 aa  92.4  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  30.36 
 
 		 401 aa  92.4  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  28.97 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  28.42 
 
 		 521 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  28.97 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  25.43 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  28.48 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  28.97 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  28.96 
 
 		 530 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0194  flagellar hook-associated protein FlgL  27.76 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  31.55 
 
 		 401 aa  89  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  28.16 
 
 		 317 aa  89  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  29.52 
 
 		 524 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30.89 
 
 		 411 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  28.48 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  28.66 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  27.85 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  26.43 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.66 
 
 		 408 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  30.49 
 
 		 396 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  31.1 
 
 		 396 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30.37 
 
 		 411 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  31.1 
 
 		 396 aa  85.5  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  22.3 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  36.75 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  29.94 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  31.94 
 
 		 594 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0247  flagellar hook-associated protein FlgL  26.33 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  28.02 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  31.22 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  27.32 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  27.01 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  26.77 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  28.11 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  27.63 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  36.05 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  36.05 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  30.12 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  30.12 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  30.12 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  33.73 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  23.34 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  26.74 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  34.88 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  34.88 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  26.78 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  28.96 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  27.39 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  33.95 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  31.93 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  24.46 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  24.46 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  23.61 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  24.36 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  31.36 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  29.89 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>