79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3634 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3634  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3450  flagellar basal body-associated protein FliL  62.58 
 
 
155 aa  192  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3951  flagellar basal body-associated protein FliL  61.94 
 
 
155 aa  190  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0052  flagellar basal body-associated protein FliL  53.95 
 
 
152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0058  flagellar basal body-associated protein FliL  51.05 
 
 
151 aa  147  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001168  flagellar biosynthesis protein FliL  35.4 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04952  hypothetical protein  35.14 
 
 
169 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0606  flagellar basal body-associated protein FliL  29.17 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1164  flagellar basal body-associated protein FliL  27.72 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.372404  normal  0.0336547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  28.78 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2177  flagellar basal body-associated protein FliL  26.85 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000145203  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2044  flagellar basal body-associated protein FliL  26.85 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.172108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1240  flagellar basal body-associated protein FliL  26.85 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.476659  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1704  flagellar basal body-associated protein FliL  26.85 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0548667  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2720  flagellar basal body-associated protein FliL  26.85 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.083272  normal  0.321922 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1698  flagellar basal body-associated protein FliL  26.85 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0974  flagellar basal body-associated protein FliL  23.7 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0154404  normal  0.0446936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0190  hypothetical protein  34.92 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.952719  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  27.27 
 
 
174 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1741  flagellar basal body-associated protein FliL  28.24 
 
 
178 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  27.27 
 
 
174 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  31.58 
 
 
180 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1407  flagellar basal body-associated protein FliL  28.16 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.875078  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1595  flagellar basal body-associated protein FliL  28.16 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  26.85 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  26.39 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  23.87 
 
 
175 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  26.92 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3438  flagellar basal body-associated protein FliL  31.58 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0840  flagellar basal body-associated protein FliL  26.73 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0488  flagellar basal body-associated protein FliL  24.14 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  31.78 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  31.78 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 
171 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  31.78 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  31.78 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0041  flagellar basal body-associated protein FliL  32.35 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0060  flagellar basal body-associated protein FliL  32.35 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1874  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361073  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0029  flagellar basal body-associated protein FliL  32.35 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0769  flagellar basal body-associated protein FliL  28.3 
 
 
184 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  24.75 
 
 
178 aa  47  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  31.78 
 
 
180 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  31.78 
 
 
180 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5230  flagellar protein FliL, putative  22.95 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1961  flagellar basal body-associated protein FliL  25.55 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.245008  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  25.74 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  32.35 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  32.35 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0314  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  22.95 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3828  flagellar basal body-associated protein FliL  26.21 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  23.53 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  28.7 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69100  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3912  flagellar basal body-associated protein FliL  25.24 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0271549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  31.37 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1433  flagellar basal body-associated protein FliL  23.14 
 
 
197 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1988  flagellar basal body-associated protein FliL  24.31 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5209  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.05 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5118  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.05 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5270  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  24.05 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.569633  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5444  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  25.32 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  32.26 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5976  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  23.81 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0271  flagellar basal body-associated protein FliL  26.21 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5032  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  22.78 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  25.44 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  26.32 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  29.91 
 
 
177 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3685  flagellar basal body-associated protein FliL  24.77 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0403111  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4203  flagellar basal body-associated protein FliL  24 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0467  flagellar basal body-associated protein FliL  25.41 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  24.21 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2937  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4359  flagellar basal body-associated protein FliL  26.04 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1507  flagellar basal body-associated protein FliL  26.04 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  26.61 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3921  flagellar basal body-associated protein FliL  25.69 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166425  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2176  flagellar basal body-associated protein FliL  23.81 
 
 
180 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>