More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3617 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  100 
 
 
102 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  74.51 
 
 
102 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  72.28 
 
 
102 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  71 
 
 
101 aa  156  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  68.63 
 
 
103 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
101 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  71.57 
 
 
101 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
101 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
101 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  67.01 
 
 
102 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
123 aa  148  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  69.61 
 
 
101 aa  147  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  70.59 
 
 
101 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  70.59 
 
 
101 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  63.73 
 
 
102 aa  146  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  69.61 
 
 
101 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  47.52 
 
 
106 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  50.98 
 
 
103 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  51.58 
 
 
108 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  50.52 
 
 
106 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  46.39 
 
 
110 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  47.42 
 
 
106 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  48.45 
 
 
112 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  49.48 
 
 
107 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  47.42 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  47.42 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  45.36 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  43.88 
 
 
109 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  43.88 
 
 
109 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  47.42 
 
 
106 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  43.88 
 
 
109 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  44.55 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  47.42 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  56 
 
 
106 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  50.52 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  48.45 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  45.92 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  49.48 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  48.94 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  46.39 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  48.81 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  43.56 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  43.88 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  47.62 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  47.62 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  47.62 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  47.62 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  47.62 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  47.62 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  45.88 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  46.43 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  40.59 
 
 
107 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  42.27 
 
 
110 aa  91.7  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  40.21 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  41.05 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  40.21 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  40.21 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  40.21 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  40.21 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  43.9 
 
 
100 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 
656 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  36.63 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  34.29 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  45.83 
 
 
245 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  40.54 
 
 
254 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  37.08 
 
 
260 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  37.08 
 
 
260 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.69 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  39.76 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  38.82 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  31.37 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  35 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
170 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  30.34 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  27.18 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  37.84 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  37.84 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  36.47 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  36.47 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  34.57 
 
 
127 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>