More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3532 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  29.8 
 
 		 4268 aa  682    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  29.4 
 
 		 5953 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.63 
 
 		 6889 aa  1169    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.03 
 
 		 3176 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  31.36 
 
 		 4101 aa  698    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  28.87 
 
 		 4968 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.43 
 
 		 6676 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  30.56 
 
 		 3308 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  29.58 
 
 		 3498 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 		 2551 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 		 1874 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  34.58 
 
 		 1656 aa  853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  33.53 
 
 		 1786 aa  942    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.48 
 
 		 1587 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  34.82 
 
 		 1646 aa  852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  30.55 
 
 		 2682 aa  1121    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  30.33 
 
 		 3133 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.59 
 
 		 4502 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  29.77 
 
 		 2273 aa  856    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  28.33 
 
 		 4960 aa  642    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  30.85 
 
 		 3044 aa  1147    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  31.84 
 
 		 4080 aa  740    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  30.36 
 
 		 3102 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  31.58 
 
 		 4165 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  30.6 
 
 		 2943 aa  1183    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  100 
 
 		 3718 aa  7698    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  29.8 
 
 		 7122 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.12 
 
 		 2762 aa  831    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  29.99 
 
 		 2679 aa  1144    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  27.94 
 
 		 4960 aa  643    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  30.61 
 
 		 2410 aa  678    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  30.1 
 
 		 2710 aa  1122    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  33.02 
 
 		 4478 aa  1027    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.03 
 
 		 3291 aa  667    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  30.89 
 
 		 1550 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  28.17 
 
 		 4196 aa  669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.51 
 
 		 3099 aa  849    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  35.05 
 
 		 3099 aa  1361    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  27.07 
 
 		 3739 aa  763    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  31.77 
 
 		 2684 aa  768    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  30.24 
 
 		 5230 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  28.91 
 
 		 3157 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  30.7 
 
 		 2176 aa  872    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  29.05 
 
 		 3148 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  29.23 
 
 		 6081 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  30.55 
 
 		 3335 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  39.89 
 
 		 1559 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.04 
 
 		 1354 aa  636  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.63 
 
 		 1349 aa  633  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.57 
 
 		 1559 aa  634  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  28.36 
 
 		 2370 aa  631  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.5 
 
 		 1349 aa  632  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  28.57 
 
 		 6072 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  30.03 
 
 		 2894 aa  629  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  30.82 
 
 		 3453 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.56 
 
 		 1337 aa  626  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  28.71 
 
 		 1569 aa  624  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.34 
 
 		 2138 aa  622  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  28.17 
 
 		 1568 aa  624  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  31.83 
 
 		 2103 aa  622  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  29.52 
 
 		 2155 aa  622  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  28.99 
 
 		 4747 aa  618  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.07 
 
 		 1087 aa  620  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  29.42 
 
 		 9498 aa  617  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  29.33 
 
 		 13537 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  29.41 
 
 		 3639 aa  615  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  29.37 
 
 		 3470 aa  610  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  29.12 
 
 		 4317 aa  611  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  28.29 
 
 		 3695 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  36.49 
 
 		 3427 aa  606  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  28.7 
 
 		 4336 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  29.05 
 
 		 1689 aa  606  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  34.49 
 
 		 3252 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  28.63 
 
 		 8914 aa  606  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  28.19 
 
 		 3207 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  28.49 
 
 		 4342 aa  602  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  27.77 
 
 		 4354 aa  604  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.11 
 
 		 5328 aa  603  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  27.89 
 
 		 5738 aa  603  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  28.88 
 
 		 2581 aa  604  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  27.95 
 
 		 6403 aa  603  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  28.6 
 
 		 4317 aa  601  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  28.03 
 
 		 4342 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  28.84 
 
 		 2151 aa  597  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.4 
 
 		 3432 aa  596  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  29.51 
 
 		 2154 aa  596  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  28.57 
 
 		 4317 aa  596  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  29.16 
 
 		 4882 aa  597  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 2374 aa  595  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.87 
 
 		 3696 aa  597  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  28.39 
 
 		 4317 aa  593  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  36.14 
 
 		 4080 aa  594  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  27.72 
 
 		 2448 aa  592  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  27.53 
 
 		 7168 aa  590  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 5154 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 5400 aa  588  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  28.08 
 
 		 4336 aa  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  27.52 
 
 		 4318 aa  587  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  28.81 
 
 		 4991 aa  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 		 3676 aa  587  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>