More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3504 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3504  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4163  cell division ATP-binding protein FtsE  90.05 
 
 		 237 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000108411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4294  cell division ATP-binding protein FtsE  90.05 
 
 		 237 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000113777  normal  0.0247872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4093  cell division ATP-binding protein FtsE  90.05 
 
 		 237 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0172  cell division ATP-binding protein FtsE  90.05 
 
 		 237 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000152449  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4585  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  89.14 
 
 		 233 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3773  cell division ATP-binding protein FtsE  89.59 
 
 		 233 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000852689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3846  cell division ATP-binding protein FtsE  89.59 
 
 		 233 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0276  cell division ATP-binding protein FtsE  89.09 
 
 		 229 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000204562  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3971  cell division ATP-binding protein FtsE  89.59 
 
 		 233 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00007474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0290  cell division ATP-binding protein FtsE  88.69 
 
 		 238 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3467  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  87.89 
 
 		 229 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3979  cell division ATP-binding protein FtsE  86.73 
 
 		 230 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000304408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0202  cell division ATP-binding protein FtsE  84.62 
 
 		 231 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000183823  decreased coverage  0.00000275574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0220  cell division ATP-binding protein FtsE  85.52 
 
 		 230 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3605  cell division ATP-binding protein FtsE  83.86 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000127054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03536  FtsE  70.51 
 
 		 237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3945  cell division ATP-binding protein FtsE  72.02 
 
 		 224 aa  330  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000529058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0159  cell division ATP-binding protein FtsE  68.81 
 
 		 235 aa  310  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0624  cell division ATP-binding protein FtsE  65.6 
 
 		 222 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4064  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  68.06 
 
 		 222 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0222  cell division protein FtsE  68.37 
 
 		 223 aa  295  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0345347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0100  cell division protein FtsE  65.47 
 
 		 223 aa  293  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00279  ABC transporter ATPase subunit  62.5 
 
 		 235 aa  292  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0094  cell division protein FtsE  65.47 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0240  cell division protein FtsE  67.44 
 
 		 222 aa  292  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.127861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0578  cell division protein FtsE  67.44 
 
 		 222 aa  292  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00281853  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3978  cell division protein FtsE  67.44 
 
 		 222 aa  291  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590462  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002139  cell division transporter ATP-binding protein FtsE  62.5 
 
 		 224 aa  291  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0306098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3839  cell division protein FtsE  66.51 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3882  cell division protein FtsE  66.51 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.166736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3772  cell division protein FtsE  66.51 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3762  cell division protein FtsE  66.51 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3867  cell division protein FtsE  66.51 
 
 		 221 aa  289  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508824  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3941  cell division protein FtsE  66.51 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03312  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  66.05 
 
 		 222 aa  287  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0253  cell division protein FtsE  66.05 
 
 		 222 aa  287  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3662  cell division protein FtsE  66.05 
 
 		 222 aa  287  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03265  hypothetical protein  66.05 
 
 		 222 aa  287  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0252  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  65.58 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3945  cell division protein FtsE  65.58 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3746  cell division protein FtsE  65.58 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3859  cell division protein FtsE  65.58 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4783  cell division protein FtsE  65.58 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3876  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  64.57 
 
 		 223 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2373  cell division ATP-binding protein FtsE  60.71 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000033444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2902  cell division ATP-binding protein FtsE  60.81 
 
 		 222 aa  281  8.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4327  cell division ATP-binding protein FtsE  59.91 
 
 		 223 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2109  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  58.53 
 
 		 217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0215  cell division ATP-binding protein  58.53 
 
 		 217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.354221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3745  cell division ATP-binding protein FtsE  60.19 
 
 		 224 aa  271  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2988  cell division ATP-binding protein FtsE  59.55 
 
 		 222 aa  264  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2660  cell division ATP-binding protein FtsE  57.27 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8795  hitchhiker  0.0000942029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3596  cell division ATP-binding protein FtsE  57.8 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0240123  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2723  hypothetical protein  60 
 
 		 216 aa  258  8e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2596  hypothetical protein  60 
 
 		 216 aa  258  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0355  cell division ATP-binding protein FtsE  55.61 
 
 		 223 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5160  cell division ATP-binding protein FtsE  55.61 
 
 		 223 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48090  Cell-division ATP-binding protein FtsE  55.91 
 
 		 222 aa  254  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5110  cell division ATP-binding protein FtsE  55.61 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4174  cell division ATP-binding protein FtsE  56.36 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00105133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4983  cell division ATP-binding protein FtsE  55.61 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5336  cell division ATP-binding protein FtsE  56.31 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4750  ABC transporter  55.86 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199681  normal  0.0424479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04910  cell division ATP-binding protein FtsE  56.36 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0953664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0428  cell division ATP-binding protein FtsE  55.86 
 
 		 223 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2989  cell division ATP-binding protein FtsE  57.08 
 
 		 226 aa  251  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.300559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0469  cell division ATP-binding protein FtsE  55.91 
 
 		 223 aa  248  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0134  cell division ATP-binding protein FtsE  54.42 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2304  cell division ATP-binding protein FtsE  57.08 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.820604  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1545  cell division ATP-binding protein FtsE  52.27 
 
 		 222 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0732  cell division ATP-binding protein FtsE  51.63 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1554  cell division ATP-binding protein FtsE  53.95 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.154084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2739  ABC transporter related  51.63 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.569673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3615  ABC transporter related  52.7 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3673  cell division ATP-binding protein FtsE  53.21 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03715  cell division ATP-binding protein FtsE  51.83 
 
 		 228 aa  228  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2155  cell division ATP-binding protein FtsE  50.92 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0169  cell division ATP-binding protein FtsE  53.95 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2244  ABC transporter ATP-binding protein  50.92 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0787455  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0375  cell division ATP-binding protein FtsE  52.53 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249019  decreased coverage  0.00264654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3717  cell division ATP-binding protein FtsE  47.47 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.780877  normal  0.114133 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2372  cell division ATP-binding protein FtsE  53.49 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.125104  hitchhiker  0.000226971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2752  cell division ATP-binding protein FtsE  53.49 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3217  cell division ATP-binding protein FtsE  50.89 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11249  normal  0.222957 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0471  cell division ATP-binding protein FtsE  50.22 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3781  cell division ATP-binding protein FtsE  49.12 
 
 		 229 aa  211  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3073  cell division ATP-binding protein FtsE  48.2 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1244  cell division ATP-binding protein FtsE  49.12 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1860  cell division ATP-binding protein FtsE  46.64 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000300417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1035  cell division ATP-binding protein FtsE  49.12 
 
 		 333 aa  208  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0057  cell division ATP-binding protein FtsE  48.36 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25190  cell division ATP-binding protein FtsE  47.37 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.661516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0519  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  44 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  47.25 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  45.61 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2907  cell division ATP-binding protein FtsE  44.14 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2400  cell division ATP-binding protein FtsE  48.18 
 
 		 262 aa  204  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0253166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3966  cell division ATP-binding protein FtsE  44 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000448693  unclonable  0.00000000011916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2665  cell division ATP-binding protein FtsE  48.64 
 
 		 273 aa  204  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0684834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>