43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3460 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  42.51 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  37.13 
 
 
163 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  37.72 
 
 
163 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  37.21 
 
 
168 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  37.13 
 
 
163 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  37.72 
 
 
154 aa  99  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  37.65 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  35.93 
 
 
163 aa  95.9  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  38.32 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  36.47 
 
 
174 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  38.32 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  35.59 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  32.77 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  31.55 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  30.38 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  34.86 
 
 
162 aa  61.6  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  32.03 
 
 
157 aa  61.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  37.96 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  33.94 
 
 
161 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  33.94 
 
 
161 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  33.03 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  34.58 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  33.03 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  33.03 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  33.03 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  33.03 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  33.03 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  33.03 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  32.11 
 
 
161 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  32.11 
 
 
161 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  32.11 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  31.78 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  31.19 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  33.06 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  33.91 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000449922  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  31.73 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  32.09 
 
 
152 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000749705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  32.48 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  31.46 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1222  protein of unknown function, Spy-related  27.33 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0499596  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  29.53 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  31.09 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>