More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3340 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3340  methylation  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  52.02 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  49.42 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  44.51 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  46.02 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  47.4 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  45.6 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  43.6 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  47.22 
 
 		 173 aa  131  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  47.88 
 
 		 174 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  47.54 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  44.83 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  45.56 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  44.94 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  41.76 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  41.3 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  41.3 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  41.86 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  41.57 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  47.48 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  39.67 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  41.21 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  40.23 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  42.68 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  38.33 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  48.44 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  34.22 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  40.11 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  37.57 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  34.12 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  38.42 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  58.95 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  47.06 
 
 		 163 aa  97.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  37.5 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  56.67 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  56.32 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  35.23 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  36.99 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  60.61 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0177  prepilin-type cleavage/methylation  41.58 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  36.69 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  37.63 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  33.7 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  33.15 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  37.08 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  34.59 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  38.12 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  34.59 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  56.92 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  34.59 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  33.71 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  34.59 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  35.14 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  51.55 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  32.96 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  35.68 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  33.15 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  32.58 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  51.47 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  32.97 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  32.97 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  51.43 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  31.69 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  46.74 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  44.09 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  32.02 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  32.97 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  40.95 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  40.95 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  40.95 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  40.95 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  32.28 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  39.22 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  38.05 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  42.22 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  43.88 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  44.57 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  42.22 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  42.22 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  31.32 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2704  type IV pilin, putative  31.32 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  27.12 
 
 		 212 aa  67.4  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  50.77 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  64.15 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  61.54 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  63.27 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  41.11 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  61.54 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  61.54 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  62 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  56.6 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  49.23 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  49.25 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  46.51 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  56.9 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  49.18 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  62 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0582  hypothetical protein  33.15 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>