137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3287 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  74.45 
 
 		 588 aa  875    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 585 aa  1212    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  74.79 
 
 		 588 aa  899    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  74.79 
 
 		 588 aa  899    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  71.84 
 
 		 587 aa  853    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  74.11 
 
 		 588 aa  890    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  72.79 
 
 		 589 aa  870    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  74.96 
 
 		 588 aa  896    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  69.34 
 
 		 590 aa  819    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  75.09 
 
 		 587 aa  852    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  74.79 
 
 		 588 aa  895    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  69.56 
 
 		 589 aa  855    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  69.88 
 
 		 589 aa  830    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  74.96 
 
 		 588 aa  896    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  69.22 
 
 		 589 aa  797    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  74.45 
 
 		 588 aa  892    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  53.08 
 
 		 576 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  52.2 
 
 		 583 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  51.86 
 
 		 617 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  51.86 
 
 		 606 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  47.64 
 
 		 557 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  45.92 
 
 		 557 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  43.94 
 
 		 564 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  45.49 
 
 		 596 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  41.53 
 
 		 600 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  40.68 
 
 		 582 aa  402  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  35.75 
 
 		 622 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  37.65 
 
 		 555 aa  347  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  38.37 
 
 		 574 aa  346  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  35.29 
 
 		 566 aa  337  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  34.95 
 
 		 587 aa  336  7.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  37.41 
 
 		 550 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  36.43 
 
 		 674 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  36.48 
 
 		 523 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  34.62 
 
 		 540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  33.04 
 
 		 541 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  33.22 
 
 		 541 aa  303  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  34.39 
 
 		 540 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  32.48 
 
 		 511 aa  246  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  31.15 
 
 		 641 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  31.07 
 
 		 528 aa  236  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  32.9 
 
 		 516 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  30.65 
 
 		 538 aa  233  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  31.4 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  29.64 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  32.95 
 
 		 523 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39432  predicted protein  29.78 
 
 		 791 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.810038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  30.32 
 
 		 529 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  32.39 
 
 		 554 aa  220  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  31.42 
 
 		 545 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 		 535 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  30.2 
 
 		 530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  29.61 
 
 		 555 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  31.89 
 
 		 618 aa  212  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  31.35 
 
 		 540 aa  212  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  30.37 
 
 		 538 aa  209  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  32.19 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  30.17 
 
 		 502 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  29.33 
 
 		 530 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  37.85 
 
 		 522 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  29.29 
 
 		 534 aa  206  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.45 
 
 		 524 aa  206  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  29.15 
 
 		 531 aa  206  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  29.97 
 
 		 679 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  31.2 
 
 		 520 aa  203  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  30.31 
 
 		 519 aa  203  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  29.22 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  36.03 
 
 		 531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  30.65 
 
 		 549 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  29.85 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  30.2 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  35.16 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  37.57 
 
 		 529 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  29.45 
 
 		 523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  36.39 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  28.62 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  31.93 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  34.86 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  33.76 
 
 		 528 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 		 670 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  27.72 
 
 		 523 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  33.06 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  35.18 
 
 		 534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  30.3 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  29.05 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  34.97 
 
 		 529 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  33.25 
 
 		 523 aa  177  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  27.49 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  33.71 
 
 		 525 aa  163  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  32.2 
 
 		 558 aa  160  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  30.93 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  26.32 
 
 		 714 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  30.24 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.16 
 
 		 524 aa  150  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  30.56 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  28.63 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  32.48 
 
 		 710 aa  136  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  30.79 
 
 		 744 aa  131  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  24.96 
 
 		 689 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  27.81 
 
 		 539 aa  113  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>