More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3286 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  701    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  77.31 
 
 		 335 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  76.72 
 
 		 380 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  76.12 
 
 		 335 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  76.12 
 
 		 335 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  77.01 
 
 		 335 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  75.82 
 
 		 335 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  75.82 
 
 		 335 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  73.95 
 
 		 363 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  75.52 
 
 		 350 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  75.22 
 
 		 353 aa  531  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  77.43 
 
 		 321 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  74.03 
 
 		 335 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  71.56 
 
 		 335 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  51.93 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  50.79 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  49.7 
 
 		 338 aa  331  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  49.11 
 
 		 338 aa  328  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  32.39 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  35 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  31.9 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  32.17 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  32.02 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  29.32 
 
 		 394 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  32.61 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  29.19 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  28.91 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  30.88 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  34.83 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  35.21 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  34.83 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  30.58 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  32.38 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  29.97 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  33.82 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  30.84 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  34.18 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  34.46 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  28.14 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  29.39 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  35.74 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  33.92 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  33.45 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  26.76 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  30.77 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  30.77 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  31.47 
 
 		 398 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  30.77 
 
 		 396 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  28.92 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  30.77 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  30.77 
 
 		 396 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  31.18 
 
 		 396 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  31.18 
 
 		 396 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  31.47 
 
 		 398 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  31.47 
 
 		 398 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  29.75 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  27.87 
 
 		 389 aa  105  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  29.82 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  30.38 
 
 		 396 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  27.87 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.09 
 
 		 701 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  29.59 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  31.12 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  30.06 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  29.91 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  28.22 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  28.22 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  29.97 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  28.22 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  30.59 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  30.53 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  28.22 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  27.87 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  27.87 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  28.04 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  28.22 
 
 		 493 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  28.22 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  28.44 
 
 		 398 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  28.22 
 
 		 399 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  29.94 
 
 		 398 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  27.81 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  29.94 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  29.73 
 
 		 408 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  31.61 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  32.58 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  28.25 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  29.08 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.06 
 
 		 699 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  28.42 
 
 		 393 aa  99.8  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  27.38 
 
 		 393 aa  99.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  27.56 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  27.63 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  32.18 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  29.23 
 
 		 397 aa  99.4  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  32.84 
 
 		 318 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  29.43 
 
 		 305 aa  99.4  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  28.67 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  30.8 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>