32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3263 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  594  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  48.55 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3394  putative replication protein  29.27 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1858  putative replication protein  29.62 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0634038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1970  putative replication protein  29.27 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1424  hypothetical protein  30.53 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000647659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1161  hypothetical protein  30.53 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000610195  hitchhiker  1.74313e-19 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  34.11 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3166  hypothetical protein  30 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168095  hitchhiker  1.83761e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1833  hypothetical protein  30 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000938078  decreased coverage  0.0000000000000142087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1756  hypothetical protein  30 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000208763  hitchhiker  0.000309878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3007  hypothetical protein  32.97 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  26.76 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  26.76 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  27.11 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  27.11 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  26.76 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  28.77 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  26.76 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  25.7 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  26.37 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  26.03 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  26.76 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  22.5 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  37.31 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  23.6 
 
 		 344 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  32.84 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  32.84 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  29.55 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4130  phage replication protein O  33.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.763522  normal  0.367122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1551  phage replication protein O, putative  24.29 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000336071 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6178  hypothetical protein  28.72 
 
 		 431 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>