172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3261 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  100 
 
 		 417 aa  854    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  80.53 
 
 		 418 aa  687    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  80.77 
 
 		 418 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  80.77 
 
 		 418 aa  689    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  81.01 
 
 		 418 aa  691    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  69.23 
 
 		 422 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  68.99 
 
 		 422 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  0.00000880604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  69.23 
 
 		 422 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  68.75 
 
 		 422 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  68.99 
 
 		 422 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  68.99 
 
 		 422 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  68.51 
 
 		 422 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000635719  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  68.99 
 
 		 422 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  68.51 
 
 		 422 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  65.62 
 
 		 420 aa  559  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  35.62 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  32.22 
 
 		 411 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  33.16 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  33.59 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  34.84 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  29.6 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  33.16 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.64 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.86 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  24.29 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  26.32 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  26.32 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  24.11 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  23.82 
 
 		 425 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  28.09 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.14 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  24.9 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  25.1 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  24.27 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  24.73 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.93 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.81 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.71 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.77 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  24.21 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  26.33 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.21 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.21 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  27.83 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  26.5 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  27.3 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  20.39 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  24.48 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  22 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  22.48 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1581  hypothetical protein  33.03 
 
 		 168 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638214  normal  0.178566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  28.25 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.89 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  23.34 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  23.37 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  26.06 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  28.03 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.7 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  24.44 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  24.84 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.17 
 
 		 374 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.17 
 
 		 374 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  24.73 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  21.02 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  25.21 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.43 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  21.76 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  22.91 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  25.38 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  21.02 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.74 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  24.79 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  23.34 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  27.31 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  23.82 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  24.81 
 
 		 515 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  25.64 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.12 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  23.28 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  22.85 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.86 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  25.96 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  23.82 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  27.65 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  29.48 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  29.48 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  25.64 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>