33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3151 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  100 
 
 
98 aa  191  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  94.25 
 
 
92 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  77.91 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2099  RebB protein  74.71 
 
 
90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5081  normal  0.0549517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2097  RebB protein  81.61 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2096  RebB protein  77.55 
 
 
96 aa  122  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.887295  normal  0.0193954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3148  RebB protein  68.6 
 
 
88 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2098  RebA protein  73.56 
 
 
88 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0527054 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  76.12 
 
 
73 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  76.12 
 
 
73 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  76.12 
 
 
73 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  76.12 
 
 
73 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  76.12 
 
 
73 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  76.12 
 
 
73 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  76.12 
 
 
73 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  52.33 
 
 
106 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01623  RebB protein  46.51 
 
 
106 aa  77  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27630  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  50 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  decreased coverage  0.00161051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3004  RebB protein  56.34 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0794  hypothetical protein  60.29 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6980  hypothetical protein  48.57 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1238  hypothetical protein  45.98 
 
 
111 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308563  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1211  hypothetical protein  45.98 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6978  hypothetical protein  45.98 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1213  hypothetical protein  45.07 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6979  hypothetical protein  44.94 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794643  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1240  hypothetical protein  45.07 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430175  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1212  hypothetical protein  43.82 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1239  hypothetical protein  44.94 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164758  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6983  hypothetical protein  42.25 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1243  hypothetical protein  39.44 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317441  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1216  hypothetical protein  39.44 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3147  hypothetical protein  45.76 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.887391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>