30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3148 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3148  RebB protein  100 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2099  RebB protein  69.77 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.5081  normal  0.0549517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3151  RebB protein  68.6 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3150  RebB protein  68.6 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3149  RebB protein  65.52 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2097  RebB protein  66.28 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0458  RebB protein  65.67 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3360  putative RebB protein  65.67 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0274  putative RebB protein  65.67 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0261  putative RebB protein  65.67 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.38666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2104  putative RebB protein  65.67 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2988  putative RebB protein  65.67 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.898476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3319  RebB protein, putative  65.67 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2096  RebB protein  65.12 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.887295  normal  0.0193954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2098  RebA protein  59.3 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0527054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27640  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  44.19 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127306  decreased coverage  0.00158217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0794  hypothetical protein  53.25 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01623  RebB protein  46.25 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3004  RebB protein  50.7 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000250436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27630  putative protein associated with synthesis and assembly of refractile inclusion bodies  40.7 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.333652  decreased coverage  0.00161051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6980  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1213  hypothetical protein  36.62 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1240  hypothetical protein  36.62 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6979  hypothetical protein  57.89 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1239  hypothetical protein  57.89 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1212  hypothetical protein  56.41 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3147  hypothetical protein  41.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.887391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1238  hypothetical protein  51.16 
 
 		 111 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1211  hypothetical protein  51.16 
 
 		 110 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6978  hypothetical protein  51.16 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>