More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3129 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  62.48 
 
 		 563 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  62.84 
 
 		 563 aa  712    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  100 
 
 		 568 aa  1163    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  62.84 
 
 		 563 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  47.86 
 
 		 580 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3491  urease domain protein  50.19 
 
 		 266 aa  276  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 569 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.33 
 
 		 574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 613 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 		 608 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.12 
 
 		 564 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.49 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3492  urease domain protein  43 
 
 		 256 aa  190  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 542 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  28.89 
 
 		 565 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.03 
 
 		 601 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.98 
 
 		 535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  28.39 
 
 		 541 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 527 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.4 
 
 		 537 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  26.61 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  29.6 
 
 		 620 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.72 
 
 		 553 aa  173  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.27 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  29.91 
 
 		 574 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  28.79 
 
 		 606 aa  170  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.07 
 
 		 560 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.48 
 
 		 589 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.78 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 569 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 616 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.34 
 
 		 553 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  26.69 
 
 		 560 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  27.08 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  28.01 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  27.35 
 
 		 544 aa  163  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.12 
 
 		 583 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.12 
 
 		 583 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.18 
 
 		 565 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  25.39 
 
 		 573 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 543 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  26.68 
 
 		 560 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  26.76 
 
 		 550 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 573 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  26.33 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.11 
 
 		 544 aa  159  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  25.83 
 
 		 596 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 556 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  27.84 
 
 		 583 aa  156  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.06 
 
 		 538 aa  156  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 548 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  27.08 
 
 		 584 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  27.8 
 
 		 532 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 548 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 548 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 543 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  27.66 
 
 		 583 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  27.79 
 
 		 576 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  25.6 
 
 		 575 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  24.7 
 
 		 558 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.32 
 
 		 530 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.06 
 
 		 533 aa  153  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  27.29 
 
 		 585 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.94 
 
 		 560 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.17 
 
 		 544 aa  150  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  27.69 
 
 		 545 aa  150  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  27.56 
 
 		 537 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  26.95 
 
 		 581 aa  146  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  26.9 
 
 		 538 aa  146  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  25.58 
 
 		 547 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  28.33 
 
 		 590 aa  146  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.17 
 
 		 583 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  27.01 
 
 		 563 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.36 
 
 		 575 aa  145  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.35 
 
 		 553 aa  145  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.36 
 
 		 575 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  27.01 
 
 		 551 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  27.05 
 
 		 580 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.76 
 
 		 564 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  25.83 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  27.03 
 
 		 549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  26.13 
 
 		 569 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  26.74 
 
 		 601 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 541 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.21 
 
 		 556 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  26.42 
 
 		 539 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  25.55 
 
 		 565 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  26.03 
 
 		 580 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.61 
 
 		 562 aa  136  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  26.78 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  26.71 
 
 		 544 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.42 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 601 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.7 
 
 		 539 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>