54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3095 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  100 
 
 		 498 aa  948    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  56.43 
 
 		 496 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  55.67 
 
 		 502 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  55.67 
 
 		 502 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  55.82 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  55.07 
 
 		 502 aa  485  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  56.22 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  56.22 
 
 		 496 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  56.22 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  55 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  52.46 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  36.52 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  33.53 
 
 		 483 aa  160  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  30.81 
 
 		 552 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  30.7 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  29.84 
 
 		 627 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  27.62 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  28.31 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  27.47 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  32 
 
 		 241 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  30.65 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  30.82 
 
 		 170 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  27.85 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  26.67 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  25 
 
 		 498 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  32.44 
 
 		 314 aa  57  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  30.65 
 
 		 517 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  28.12 
 
 		 415 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  28.86 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  40.26 
 
 		 139 aa  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  33.33 
 
 		 144 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  40.26 
 
 		 139 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  40.26 
 
 		 139 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  36.27 
 
 		 139 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  36.27 
 
 		 139 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  37.66 
 
 		 139 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  35.35 
 
 		 142 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  33.04 
 
 		 183 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  33.68 
 
 		 144 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  31.78 
 
 		 151 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  31.78 
 
 		 151 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  31.78 
 
 		 151 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  31.78 
 
 		 151 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  30.51 
 
 		 151 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  26.59 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  31.78 
 
 		 151 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  27.1 
 
 		 481 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  31.91 
 
 		 139 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  33.33 
 
 		 157 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  28.97 
 
 		 160 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  29.45 
 
 		 139 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  28.97 
 
 		 160 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  28.97 
 
 		 160 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  30.33 
 
 		 190 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>