41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3014 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  73.15 
 
 		 221 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  58.33 
 
 		 219 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  58.22 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  58.22 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  58.22 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  58.22 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  55.3 
 
 		 217 aa  261  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  52.78 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  42.92 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  39.09 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  39.65 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  45.38 
 
 		 129 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  30.92 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  27.48 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  23.27 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  28.97 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  23.62 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  27.71 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  25.17 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  29.01 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  27.33 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  25.41 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  26.78 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  22.73 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  26.92 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  25.54 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  25 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46702  predicted protein  29.66 
 
 		 337 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  26.15 
 
 		 566 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  27.35 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28521  predicted protein  26.97 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  21.97 
 
 		 214 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>