15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2988 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2988  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  613  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0641  hypothetical protein  44.7 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000277282 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3379  hypothetical protein  44.7 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000346578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0641  hypothetical protein  44.37 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0670  hypothetical protein  44.67 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4005  hypothetical protein  44.04 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0597  hypothetical protein  44.7 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0528  hypothetical protein  40.84 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3854  hypothetical protein  44.37 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000149063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3671  hypothetical protein  44.37 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.286479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3728  hypothetical protein  44.37 
 
 		 290 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39040  hypothetical protein  32.45 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4083  hypothetical protein  23.08 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1854  hypothetical protein  25.45 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2242  hypothetical protein  27.78 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>