237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2975 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  100 
 
 		 319 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  89.87 
 
 		 317 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  87.9 
 
 		 317 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  87.9 
 
 		 316 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  87.26 
 
 		 317 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  87.58 
 
 		 317 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  87.58 
 
 		 317 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  86.71 
 
 		 317 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  85.4 
 
 		 317 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  86.03 
 
 		 315 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  84.08 
 
 		 316 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  85.71 
 
 		 315 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  85.71 
 
 		 315 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  86.03 
 
 		 315 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  84.66 
 
 		 315 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  80.7 
 
 		 316 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  70.79 
 
 		 318 aa  489  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  72.93 
 
 		 316 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  72.93 
 
 		 316 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  71.2 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  71.2 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  71.2 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  71.2 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  71.43 
 
 		 315 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  71.2 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  71.2 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  71.2 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  71.2 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  70.79 
 
 		 315 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  70.57 
 
 		 316 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  70.03 
 
 		 328 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  70.38 
 
 		 318 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  68.89 
 
 		 315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  68.89 
 
 		 315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  69.72 
 
 		 319 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  70.83 
 
 		 317 aa  467  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  68.89 
 
 		 315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  68.89 
 
 		 315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  70.03 
 
 		 319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  70.03 
 
 		 319 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  68.57 
 
 		 315 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  69.4 
 
 		 317 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  69.21 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  68.65 
 
 		 319 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  68.65 
 
 		 319 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  67.62 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  65.08 
 
 		 317 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  64.44 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  63.81 
 
 		 317 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  64.13 
 
 		 317 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  63.34 
 
 		 318 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  61.81 
 
 		 310 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  64.94 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  63.17 
 
 		 319 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  63.17 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  64.61 
 
 		 317 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  60.19 
 
 		 317 aa  415  9.999999999999999e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  61.9 
 
 		 318 aa  411  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  61.98 
 
 		 316 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  61.46 
 
 		 317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  60.19 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  60.13 
 
 		 317 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  59.11 
 
 		 315 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  57.37 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  57.32 
 
 		 321 aa  384  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  53.8 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  53.8 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  53.53 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  50.79 
 
 		 325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  52.24 
 
 		 327 aa  348  6e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  53.7 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  52.24 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  50.94 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3090  glutathione synthetase  55.02 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  52.29 
 
 		 313 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  52.23 
 
 		 316 aa  331  8e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  52.24 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  50.63 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  49.53 
 
 		 315 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  51.29 
 
 		 323 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  51.44 
 
 		 318 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  51.44 
 
 		 318 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  51.44 
 
 		 318 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  51.44 
 
 		 318 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  51.44 
 
 		 318 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  51.44 
 
 		 318 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  51.44 
 
 		 318 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 314 aa  325  7e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  51.12 
 
 		 317 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  51.28 
 
 		 319 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  52.09 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  50.64 
 
 		 319 aa  320  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  50.8 
 
 		 318 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  49.68 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0926  glutathione synthetase  48.9 
 
 		 318 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  50.8 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  50.48 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0010  glutathione synthetase  49.38 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163572  normal  0.0543888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0259  glutathione synthetase  50.8 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  49.68 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>