25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2944 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  89.27 
 
 		 208 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  66.83 
 
 		 199 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  64.65 
 
 		 216 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  58.29 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  49.32 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  39.6 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  25.75 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  24.88 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  22.82 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  23.58 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  24.34 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  26.26 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  26.44 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  22.62 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  22.71 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  23.32 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  20.35 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  25.37 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  20.09 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  21.68 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  19.67 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  26.5 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  22.89 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  22.4 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>