More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2931 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  76.88 
 
 		 858 aa  1375    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  51.45 
 
 		 877 aa  857    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  43.59 
 
 		 1015 aa  685    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 870 aa  1773    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  48.84 
 
 		 856 aa  782    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  76.27 
 
 		 867 aa  1362    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  60.99 
 
 		 869 aa  1058    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  75.54 
 
 		 867 aa  1357    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  76.05 
 
 		 861 aa  1357    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  80.57 
 
 		 851 aa  1431    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  75.63 
 
 		 857 aa  1372    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  50.24 
 
 		 867 aa  786    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  37.66 
 
 		 864 aa  547  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  37.84 
 
 		 823 aa  532  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 868 aa  522  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 872 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 800 aa  419  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 797 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 797 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 797 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 812 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 797 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 817 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 812 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 812 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 843 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 803 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.6 
 
 		 800 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  31.43 
 
 		 797 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 853 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 817 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 800 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  31.45 
 
 		 870 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 948 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 918 aa  340  9e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 795 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 853 aa  330  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  29.02 
 
 		 793 aa  327  6e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 793 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  29.53 
 
 		 821 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.5 
 
 		 799 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 874 aa  314  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 815 aa  312  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 842 aa  308  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 804 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 924 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 835 aa  300  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.74 
 
 		 811 aa  294  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.69 
 
 		 832 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  30.74 
 
 		 884 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 795 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 987 aa  286  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 947 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 847 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 833 aa  266  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 858 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 924 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 933 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 813 aa  238  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 803 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 847 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  29.7 
 
 		 848 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  31.19 
 
 		 795 aa  207  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  30.3 
 
 		 784 aa  204  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  29.2 
 
 		 840 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  29.62 
 
 		 961 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 811 aa  191  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  29.62 
 
 		 788 aa  191  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 788 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 883 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 815 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 811 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  27.84 
 
 		 948 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 887 aa  171  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 871 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  36.66 
 
 		 818 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 850 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 842 aa  161  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 885 aa  157  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 855 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 853 aa  154  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 853 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 853 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 853 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 843 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 855 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 842 aa  149  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.19 
 
 		 839 aa  146  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 838 aa  144  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  24.95 
 
 		 853 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  34.32 
 
 		 816 aa  141  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 841 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 904 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 849 aa  135  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 904 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 904 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 869 aa  131  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 904 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  25.87 
 
 		 709 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 866 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>