149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2916 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  289  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  40.28 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  39.16 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  40.28 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  31.97 
 
 		 178 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  37.5 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  37.5 
 
 		 317 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  35.14 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  35.53 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  40.58 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  40.56 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  38.24 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  38.89 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  36.96 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  35.61 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  39.86 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  38.33 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  32.41 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  43.36 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  32.45 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  37.41 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  38.56 
 
 		 318 aa  77.8  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  34.88 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  34.13 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  34.88 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  34.88 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  39.13 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  32.17 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  29.71 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  35.95 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  34.03 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  31.88 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  33.58 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  35.2 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  34.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  36.84 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  38.76 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  34.46 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  29.17 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  31.69 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  32.59 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  30.72 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  31.58 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  33.78 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  37.17 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  33.78 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  31.79 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  32.14 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  29.45 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  35.07 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  33.11 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  31.79 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  36.5 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  33.07 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  35.77 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  32.64 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  28.48 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  30.41 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  25.68 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  43.42 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  33.61 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  26.03 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  26.03 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  34.92 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  36.84 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  42.11 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  29.69 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  43.42 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.56 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  28.89 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  28.37 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  28.91 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  28.08 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  32.54 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  30.22 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  30.22 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  31.75 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  34.31 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  34.4 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  27.89 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  29.82 
 
 		 333 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  29.93 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  34.62 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  30.71 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  28.77 
 
 		 320 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  28.77 
 
 		 313 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  28.77 
 
 		 313 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  30.23 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  33.1 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  28.15 
 
 		 333 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>