48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2907 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2907  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  246  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3983  hypothetical protein  53.28 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0619  hypothetical protein  55.37 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000809735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0655  hypothetical protein  50.82 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3366  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000215688  normal  0.0226874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0656  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000101119  normal  0.209543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3837  hypothetical protein  51.64 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298104  hitchhiker  0.00217441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3714  hypothetical protein  50.82 
 
 		 204 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000655627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0682  hypothetical protein  50.82 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000132631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0841  hypothetical protein  54.1 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0791  hypothetical protein  50.83 
 
 		 195 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000670126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3655  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000914261  hitchhiker  0.00000165817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0645  hypothetical protein  51.67 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00602467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0969  hypothetical protein  51.64 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0828  hypothetical protein  47.97 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00283176  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0928  hypothetical protein  51.64 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000245839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0134  hypothetical protein  37.19 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1513  hypothetical protein  36.89 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135628  hitchhiker  0.000151477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2591  hypothetical protein  36.07 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2897  hypothetical protein  37.4 
 
 		 123 aa  76.6  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.223027  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0112  hypothetical protein  35.25 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.7804e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002571  hypothetical protein  34.17 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000160923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3540  hypothetical protein  35.25 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000680081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0126  hypothetical protein  35.25 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000088286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00117  hypothetical protein  35.25 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000369224  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00118  hypothetical protein  35.25 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000974405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0121  hypothetical protein  35.25 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0756239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3483  conserved hypothetical protein  35.25 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000106382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0123  hypothetical protein  35.25 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.5031e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03438  hypothetical protein  34.17 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1027  hypothetical protein  36.07 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3358  hypothetical protein  36.07 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000532345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3486  hypothetical protein  36.07 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000145157  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0826  hypothetical protein  37.1 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.171792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0129  hypothetical protein  34.43 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0640  hypothetical protein  36.8 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0683  hypothetical protein  36 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0175  hypothetical protein  34.43 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0191  hypothetical protein  34.43 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000796415  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0175  hypothetical protein  34.43 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0413921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0667  hypothetical protein  31.97 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000546212  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3552  hypothetical protein  35.54 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1389  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0183  hypothetical protein  33.61 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0179  hypothetical protein  33.61 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000658867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3727  hypothetical protein  35.54 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.25807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0703  hypothetical protein  30.47 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4007  hypothetical protein  35 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>