55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2857 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  40.91 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  36.69 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  36.69 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  43.22 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  36.69 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  36.69 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  40.74 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  42.37 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  42.37 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  41.53 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  41.67 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  36.76 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  39.39 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  39.13 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.82 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  35.56 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  36.76 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.51 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  30.28 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  26.89 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  29.66 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  26.87 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  33.88 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  31.13 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  31.09 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  30.23 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  25.58 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  27.46 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.93 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  25.53 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  21.05 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  27.59 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  28.44 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  27.74 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  23.88 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  28.12 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  26.15 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  23.91 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  20.83 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  23.53 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  23.91 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  23.68 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  24.09 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  25.71 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  22.13 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  21.21 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  25.58 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  24.47 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  24.79 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  22.64 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  28.16 
 
 		 272 aa  40  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>