More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2815 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  100 
 
 
116 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  90.52 
 
 
116 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  88.79 
 
 
116 aa  216  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  88.79 
 
 
116 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  88.79 
 
 
116 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  88.79 
 
 
116 aa  216  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  87.93 
 
 
116 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  87.93 
 
 
116 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  87.93 
 
 
116 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  87.93 
 
 
116 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  84.48 
 
 
116 aa  204  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  83.62 
 
 
116 aa  202  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  89.81 
 
 
108 aa  202  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  84.35 
 
 
120 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  82.61 
 
 
122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0843  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  85.34 
 
 
116 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  75.68 
 
 
113 aa  182  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  77.27 
 
 
115 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  77.27 
 
 
115 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  74.77 
 
 
114 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  73.28 
 
 
116 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  74.77 
 
 
114 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75 
 
 
114 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  74.77 
 
 
114 aa  177  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.57 
 
 
118 aa  177  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.41 
 
 
114 aa  177  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  71.43 
 
 
114 aa  174  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  71.43 
 
 
114 aa  174  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  71.43 
 
 
114 aa  174  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  71.43 
 
 
113 aa  173  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2571  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  69.03 
 
 
113 aa  172  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.37717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03416  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  69.64 
 
 
118 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002592  probable iron binding protein from the HesB_IscA_SufA family  69.91 
 
 
113 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000217279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0156  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  69.91 
 
 
113 aa  170  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  68.1 
 
 
116 aa  167  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  67.83 
 
 
116 aa  167  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  66.38 
 
 
116 aa  166  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.75 
 
 
126 aa  166  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.1 
 
 
115 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  65.22 
 
 
116 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  68.1 
 
 
116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  67.29 
 
 
113 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  68.1 
 
 
116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.81 
 
 
110 aa  163  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  71.15 
 
 
116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.1 
 
 
120 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.66 
 
 
132 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.79 
 
 
116 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.66 
 
 
132 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.66 
 
 
132 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.66 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  64.66 
 
 
116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.66 
 
 
116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.79 
 
 
123 aa  158  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  67.57 
 
 
121 aa  158  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.86 
 
 
123 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.86 
 
 
123 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.86 
 
 
123 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.29 
 
 
123 aa  157  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.91 
 
 
123 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.35 
 
 
121 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.91 
 
 
123 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  66.36 
 
 
124 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  66.36 
 
 
124 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0225  HesB family protein  63.55 
 
 
115 aa  157  5e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  66.36 
 
 
130 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  66.36 
 
 
124 aa  156  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.18 
 
 
122 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.18 
 
 
122 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.18 
 
 
122 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.18 
 
 
122 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.18 
 
 
122 aa  156  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.18 
 
 
122 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.18 
 
 
122 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.18 
 
 
122 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.83 
 
 
121 aa  156  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.16 
 
 
120 aa  156  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.39 
 
 
124 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.39 
 
 
124 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.39 
 
 
121 aa  154  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.39 
 
 
121 aa  154  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  64.15 
 
 
117 aa  154  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.39 
 
 
121 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.61 
 
 
121 aa  153  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0556  HesB/YadR/YfhF  65.18 
 
 
113 aa  153  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.208955  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.61 
 
 
121 aa  153  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>