50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2737 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 
181 aa  366  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  51.4 
 
 
180 aa  205  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.14 
 
 
181 aa  198  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.59 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.44 
 
 
178 aa  195  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55 
 
 
180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50.84 
 
 
183 aa  194  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
178 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
178 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  50 
 
 
178 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
178 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
178 aa  190  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
178 aa  190  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  50.29 
 
 
179 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50 
 
 
178 aa  189  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  48.88 
 
 
178 aa  184  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.81 
 
 
179 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  31.21 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  32.12 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  29.51 
 
 
213 aa  98.6  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  30.49 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  26.14 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  28.33 
 
 
196 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.14 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  27.78 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.81 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  27.84 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  26.67 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  28.67 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  29.94 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  26.95 
 
 
196 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.47 
 
 
199 aa  60.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.21 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.95 
 
 
191 aa  54.3  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  23.78 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.71 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.38 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  25.28 
 
 
437 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  27.08 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  28 
 
 
207 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  22.99 
 
 
222 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  24.14 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  26.9 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  24.59 
 
 
343 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.77 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.16 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  25.2 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  24.48 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  23.02 
 
 
188 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  28.3 
 
 
213 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>