More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2733 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  100 
 
 
377 aa  782    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  81.7 
 
 
373 aa  617  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  76.92 
 
 
376 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  65.42 
 
 
367 aa  501  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  61.39 
 
 
365 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  61.66 
 
 
367 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  62.03 
 
 
368 aa  481  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  58.95 
 
 
370 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  58.07 
 
 
372 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  58.33 
 
 
372 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  57.82 
 
 
366 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  57.29 
 
 
373 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  56.05 
 
 
369 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  55.26 
 
 
369 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  55.26 
 
 
369 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  55.61 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.25 
 
 
344 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  30.93 
 
 
346 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  29.76 
 
 
341 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  36.28 
 
 
344 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  41.78 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  41.78 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  45.16 
 
 
345 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35.76 
 
 
344 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40.27 
 
 
351 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  48.68 
 
 
344 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  48.68 
 
 
344 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  48.03 
 
 
344 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  28.97 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.42 
 
 
333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  33.57 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.18 
 
 
429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  29.14 
 
 
394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  43.83 
 
 
366 aa  126  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  35.57 
 
 
352 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  29.3 
 
 
381 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.98 
 
 
447 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  41.36 
 
 
380 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  36.25 
 
 
367 aa  122  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.29 
 
 
345 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  28.92 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.06 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  40.67 
 
 
201 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 
331 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  36.73 
 
 
337 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  34.52 
 
 
212 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  29.12 
 
 
454 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  26.82 
 
 
369 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  29.55 
 
 
468 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.16 
 
 
201 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
201 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  38.93 
 
 
202 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  27.82 
 
 
420 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  35.67 
 
 
201 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.25 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  28.48 
 
 
466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  37.42 
 
 
201 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  32.8 
 
 
201 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.91 
 
 
209 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  38.67 
 
 
201 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  36.46 
 
 
205 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  39.87 
 
 
376 aa  106  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 
200 aa  106  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  36.56 
 
 
337 aa  105  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  39.22 
 
 
204 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 
459 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 
459 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 
202 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  39.19 
 
 
202 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  38.51 
 
 
201 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  37.65 
 
 
204 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 
202 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.67 
 
 
401 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  36.49 
 
 
208 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 
202 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 
185 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  26.54 
 
 
367 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  37.58 
 
 
202 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  37.84 
 
 
204 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  28.17 
 
 
321 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  26.29 
 
 
326 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  37.58 
 
 
202 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.44 
 
 
240 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  27.81 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  26.18 
 
 
319 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
314 aa  99  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  26.08 
 
 
320 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.71 
 
 
466 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  41.67 
 
 
457 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
210 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  26.18 
 
 
319 aa  96.3  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  25.84 
 
 
330 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  26.18 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.97 
 
 
237 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  27.35 
 
 
342 aa  94  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  27.33 
 
 
356 aa  94  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 
428 aa  93.2  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>