More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2538 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
307 aa  603  1e-172  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.12152e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  82.74 
 
 
307 aa  505  1e-142  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  4.76091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.5 
 
 
308 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.5 
 
 
308 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.68731e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  78.83 
 
 
308 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.83 
 
 
308 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.85781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  77.85 
 
 
308 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  79.21 
 
 
308 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.27922e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  79.15 
 
 
307 aa  468  1e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  78.88 
 
 
308 aa  459  1e-128  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  78.88 
 
 
308 aa  459  1e-128  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  78.18 
 
 
308 aa  458  1e-128  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.28424e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  73.94 
 
 
307 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  72.96 
 
 
307 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.11397e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.93 
 
 
307 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.59 
 
 
307 aa  445  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  69.81 
 
 
308 aa  434  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.88 
 
 
308 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.52 
 
 
309 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  66.99 
 
 
311 aa  401  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.02 
 
 
309 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.01 
 
 
310 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.17 
 
 
309 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.61 
 
 
308 aa  384  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.52 
 
 
309 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.78 
 
 
308 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.2 
 
 
310 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  66.89 
 
 
309 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.02 
 
 
309 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.81 
 
 
314 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  67.21 
 
 
309 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.49 
 
 
313 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  65.29 
 
 
314 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.31 
 
 
312 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.7 
 
 
313 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  65.37 
 
 
309 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.9 
 
 
310 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.43 
 
 
309 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.99 
 
 
309 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.19 
 
 
311 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.05 
 
 
309 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0422  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.01 
 
 
310 aa  364  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.87 
 
 
311 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.11 
 
 
309 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.84 
 
 
310 aa  362  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.11 
 
 
309 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  60.9 
 
 
321 aa  361  9e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  63.11 
 
 
309 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  60.32 
 
 
310 aa  360  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  64.38 
 
 
311 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.94 
 
 
311 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  63.31 
 
 
310 aa  359  3e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.43 
 
 
309 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.52 
 
 
310 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.34 
 
 
310 aa  358  5e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  66.02 
 
 
309 aa  358  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  63.55 
 
 
311 aa  357  1e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  357  1e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  357  1e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.11 
 
 
309 aa  357  1e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  357  1e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  65.58 
 
 
309 aa  357  1e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  357  1e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  357  1e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  357  1e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
311 aa  357  1e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.11 
 
 
311 aa  356  2e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.74 
 
 
315 aa  355  4e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.9 
 
 
311 aa  355  4e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  355  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.9 
 
 
311 aa  355  6e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.28 
 
 
319 aa  353  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  62.78 
 
 
309 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  61.11 
 
 
314 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
310 aa  351  9e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  59.87 
 
 
314 aa  349  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.14 
 
 
309 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.16 
 
 
310 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.61 
 
 
310 aa  348  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.11 
 
 
309 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.26 
 
 
310 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.58 
 
 
310 aa  346  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2706  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.72 
 
 
309 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.796213  normal  0.172174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.84 
 
 
309 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.94 
 
 
310 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.35 
 
 
313 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  57.93 
 
 
312 aa  343  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  57.61 
 
 
312 aa  342  3e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  62.66 
 
 
314 aa  342  6e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.29 
 
 
310 aa  340  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2169  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.65 
 
 
310 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0328573  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.97 
 
 
317 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.26 
 
 
311 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.26 
 
 
317 aa  339  3e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>