276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2449 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  100 
 
 
286 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  85.61 
 
 
286 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  85.61 
 
 
302 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  85.61 
 
 
302 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  85.26 
 
 
302 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  83.22 
 
 
286 aa  501  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  84.21 
 
 
286 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  83.51 
 
 
286 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  82.81 
 
 
286 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  83.16 
 
 
286 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  82.81 
 
 
286 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  76.51 
 
 
292 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  76.33 
 
 
286 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  73.14 
 
 
285 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2911  phosphotransferase domain-containing protein  70.92 
 
 
287 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  71.93 
 
 
286 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  52.22 
 
 
292 aa  291  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1898  putative phosphoesterase  54.21 
 
 
293 aa  290  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000460558 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1375  putative phosphoesterase  54.58 
 
 
286 aa  290  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2383  PHP domain protein  54.58 
 
 
293 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2362  phosphotransferase domain-containing protein  54.58 
 
 
293 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1155  hypothetical protein  53.33 
 
 
281 aa  289  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2666  phosphotransferase domain-containing protein  53.31 
 
 
295 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000470189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1848  putative phosphoesterase  53.65 
 
 
282 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  hitchhiker  0.000620806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1867  putative phosphoesterase  54.21 
 
 
293 aa  289  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000652478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01240  hypothetical protein  54.21 
 
 
293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01250  hypothetical protein  54.21 
 
 
293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1465  putative phosphoesterase  54.21 
 
 
286 aa  288  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1490  putative phosphoesterase  53.85 
 
 
286 aa  288  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1853  putative phosphoesterase  53.28 
 
 
282 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1607  putative phosphoesterase  53.28 
 
 
282 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1911  putative phosphoesterase  53.28 
 
 
282 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000200072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1425  putative phosphoesterase  53.28 
 
 
282 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.769482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  52.21 
 
 
291 aa  287  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  53.16 
 
 
297 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0798  hypothetical protein  50 
 
 
290 aa  276  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2203  phosphotransferase domain-containing protein  53.11 
 
 
298 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  51.09 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  47.62 
 
 
301 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2171  PHP domain protein  52.94 
 
 
290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2008  PHP domain protein  52.77 
 
 
296 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.208855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003090  PHP family hydrolase  50.8 
 
 
264 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  46.01 
 
 
288 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1930  phosphotransferase domain-containing protein  52.54 
 
 
299 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2041  phosphotransferase domain-containing protein  52.54 
 
 
311 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.67494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2311  phosphotransferase domain-containing protein  52.17 
 
 
310 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02287  PHP domain protein  47.6 
 
 
297 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.624872  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  46.3 
 
 
269 aa  248  6e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  46.72 
 
 
278 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  46.49 
 
 
286 aa  231  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  46.49 
 
 
286 aa  231  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  44.24 
 
 
284 aa  218  8.999999999999998e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  41.61 
 
 
279 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  41.03 
 
 
279 aa  208  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  40.29 
 
 
279 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  42.65 
 
 
277 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  41.33 
 
 
288 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5406  PHP-like metal-dependent phosphoesterase  42.39 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1626  phosphotransferase domain-containing protein  44.04 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  42.49 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  44.69 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  44.32 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  45.28 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  41.82 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  41.91 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  40.59 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  40.79 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3236  PHP-like  42.14 
 
 
319 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  40.94 
 
 
279 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  41.03 
 
 
276 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  40.94 
 
 
279 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  40.94 
 
 
279 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4021  PHP domain protein  39.78 
 
 
285 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  41.39 
 
 
276 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1174  phosphotransferase domain-containing protein  40.73 
 
 
279 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806701  decreased coverage  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  40.15 
 
 
287 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2570  putative phosphoesterase  41.39 
 
 
276 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1683  phosphoesterase, putative  41.39 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.478385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2582  phosphotransferase domain-containing protein  41.22 
 
 
298 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2703  metal-dependent phosphoesterase  41.39 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1458  putative phosphoesterase  41.39 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525021  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2624  putative phosphoesterase  41.39 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3132  putative phosphoesterase  41.39 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322538  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2185  putative phosphoesterase  41.39 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  39.78 
 
 
287 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1100  PHP, C-terminal  40.79 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3707  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 
287 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3274  phosphotransferase domain-containing protein  39.64 
 
 
287 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5411  phosphotransferase domain-containing protein  39.64 
 
 
287 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.861836 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3431  phosphotransferase domain-containing protein  39.64 
 
 
292 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2763  PHP domain protein  39.64 
 
 
292 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1901  phosphoesterase, putative  40.66 
 
 
276 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2756  hypothetical protein  40.21 
 
 
287 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.308411  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1683  PHP domain protein  40.81 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1005  PHP-like  40.51 
 
 
286 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  37.01 
 
 
303 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  37.23 
 
 
287 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1528  phosphoesterase PHP  39.11 
 
 
287 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0994  PHP domain protein  38.91 
 
 
283 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016176  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15640  Phosphoesterase (PHP family)  41 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>