More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2359 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  628  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  77.7 
 
 		 302 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  73.54 
 
 		 305 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  73.2 
 
 		 305 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  73.2 
 
 		 305 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  72.85 
 
 		 305 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  70.89 
 
 		 302 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  71.38 
 
 		 303 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  71.72 
 
 		 304 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  70.69 
 
 		 303 aa  431  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  71.03 
 
 		 303 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  71.03 
 
 		 303 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  71.68 
 
 		 303 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  71.03 
 
 		 302 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  69.52 
 
 		 308 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  68.26 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  59.26 
 
 		 319 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  59.26 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  57.57 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  59.32 
 
 		 319 aa  354  8.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  51.01 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  51.03 
 
 		 313 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  47.7 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  47.23 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  48.33 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  49.31 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  48.79 
 
 		 318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  46.89 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  47.8 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  47.24 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  47.87 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  47.24 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  46.83 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  46.34 
 
 		 308 aa  255  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  42.76 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  42.28 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  40.55 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  43.14 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  37.75 
 
 		 320 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  33.54 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  34.33 
 
 		 338 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  30.19 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  30.49 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  32.74 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  32.74 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  32.74 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  32.74 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  31.34 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  32.51 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  31.31 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  32.63 
 
 		 321 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  32.38 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  32.1 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  30.67 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  31.87 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  32.75 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  30.99 
 
 		 350 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  29.28 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  28.14 
 
 		 396 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  31.17 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  28.14 
 
 		 396 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  28.52 
 
 		 396 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  30.45 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.1 
 
 		 807 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  27.76 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  27.76 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  27.76 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  27.76 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  27.76 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  33.02 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  27.38 
 
 		 396 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  31.2 
 
 		 400 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  27.76 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  31.3 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  26.82 
 
 		 395 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  34.13 
 
 		 404 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  27.76 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  27.76 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  27.76 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  26.16 
 
 		 395 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  27.76 
 
 		 403 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  30.36 
 
 		 398 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  30.47 
 
 		 560 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  32.71 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  28.37 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  28.46 
 
 		 396 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  33.17 
 
 		 404 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  32.26 
 
 		 493 aa  96.3  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  28.63 
 
 		 400 aa  95.9  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  31.64 
 
 		 400 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  33.73 
 
 		 392 aa  95.9  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  32.69 
 
 		 404 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  32.69 
 
 		 404 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  32.69 
 
 		 404 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 400 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  32.69 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  30.09 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  28.57 
 
 		 400 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  33.7 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  32.69 
 
 		 404 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>