More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2278 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  100 
 
 		 310 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  77.67 
 
 		 309 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  77.7 
 
 		 306 aa  520  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  80 
 
 		 307 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  76.39 
 
 		 309 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  63.58 
 
 		 309 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  63.58 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  64.45 
 
 		 309 aa  424  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  62.58 
 
 		 306 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  63.91 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  60.78 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  61.11 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  61.11 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  61.11 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  61.44 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  61.11 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  61.11 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  60.78 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  61.11 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  60.78 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  61.44 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  61.44 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  61.44 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  61.44 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  61.44 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  54.87 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  50.67 
 
 		 319 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  52.92 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  52.55 
 
 		 321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  52.19 
 
 		 321 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  47.26 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  44.52 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  44.52 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  44.52 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  45.89 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  44.86 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  45.89 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  45.89 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  45.55 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  45.55 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  43.49 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  44.86 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  45.96 
 
 		 316 aa  245  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  44.52 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  44.41 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  42.14 
 
 		 316 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  40.92 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  42.11 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  41.78 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  44.86 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  44.56 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  45.89 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  45.17 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  45 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  45.83 
 
 		 322 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  43.64 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  44.03 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  40.46 
 
 		 317 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  44.2 
 
 		 329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  44.93 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  44.44 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  45.29 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  45.29 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  44.57 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  43.57 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  44.57 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  44.93 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  43.21 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  44.2 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  41.37 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  41.52 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  43.21 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  43.21 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.29 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  43.21 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  43.53 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  40.57 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  43.21 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  39.29 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  39.94 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  41.2 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  41.36 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  41.36 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  39.07 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  41.4 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  41.34 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  39.09 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  40.34 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  40.78 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  40.94 
 
 		 317 aa  198  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  41.3 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  41.3 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  40.43 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  40.59 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  40.43 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>